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modeller补全残基，配体分子总是不能被包括进去。
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大家好，我用modeller补全晶体结构（晶体结构缺少一段loop区，7个氨基酸长度），我想把配体分子也考虑进去。晶体结构中有两个配体，因此在alignment.ali文件中我在pdb文件 和序列文件 的最后部分加了两个点：ASPKE..* 在select.py文件中也加入了命令：env.io.hetatm = True 可是总是出错，显示：number of residues in the alignment and pdb files are different: 303 301 如果去掉这两个点，可以正常结束，得到模建好的结构。可是加上两个点后，总是出现这样的问题，请前辈们指点一二，非常感谢。 |
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