应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » LAMMPS Error:lost atoms
51/1返回列表
查看: 3748  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

xxh418

新虫 (初入文坛)

[求助] LAMMPS Error:lost atoms

大家好：
用LAMMPS模拟一个晶体体系， 用的 P P S边界条件，一运行，出现ERROR： LOST ATOMS, ORIGINAL: *** ,NOW***. 奇怪的是我检查LOG文件，发现一开始程序是根据BOX设定找到了所有原子，可是在第一步初始计算还没开始时候出现此错误，所以不应该是步长问题，也减小了步长，确实不是不长问题，也没有原子重合之类问题。还有一个奇怪的是我用4个CORE，出现上述问题，如意用一个CORE，就可以运行了，不知道大家有什么建议
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-10-15 14:11:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wbing58

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
6楼2013-10-24 22:09:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

wang06x

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
ghcacj(金币+1): 谢谢 2011-10-18 09:37:11
运行之前，先用minimize命令试试。
赞一下(1人) 回复此楼
低调
2楼2011-10-18 08:17:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaorongwei

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
御剑江湖(金币+4): 谢谢 2011-10-18 20:17:14
引用回帖:
1楼: Originally posted by xxh418 at 2011-10-15 14:11:06:
大家好：
用LAMMPS模拟一个晶体体系， 用的 P P S边界条件，一运行，出现ERROR： LOST ATOMS, ORIGINAL: *** ,NOW***. 奇怪的是我检查LOG文件，发现一开始程序是根据BOX设定找到了所有原子，可是在第一步初始计算 ...

z方向边界条件是S，在原有BOX大小的基础上将z方向的大小调大一点试试（假设盒子大小为-10,10，而填充原子部分为-9,9）。这样好像可以的。
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-10-18 16:51:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xxh418

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wang06x at 2011-10-18 08:17:07:
运行之前，先用minimize命令试试。

谢谢回复， 如我帖子里提到，LOST ATOM是发生在计算初始能量之前报错，所以应该不是由于原子重贴所引起的。
赞一下 回复此楼
4楼2011-10-19 12:17:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭