3楼: Originally posted by xiaorongwei at 2011-10-18 16:51:27:
z方向边界条件是S，在原有BOX大小的基础上将z方向的大小调大一点试试（假设盒子大小为-10,10，而填充原子部分为-9,9）。这样好像可以的。

1楼: Originally posted by xxh418 at 2011-10-15 14:11:06:
大家好：
用LAMMPS模拟一个晶体体系， 用的 P P S边界条件，一运行，出现ERROR： LOST ATOMS, ORIGINAL: *** ,NOW***. 奇怪的是我检查LOG文件，发现一开始程序是根据BOX设定找到了所有原子，可是在第一步初始计算 ...

2楼: Originally posted by wang06x at 2011-10-18 08:17:07:
运行之前，先用minimize命令试试。