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gyldmy

铜虫 (小有名气)

[求助] MD结果的分析

如题:本人初学MS,对MS知之甚少,老板要我学MD,自己琢磨加大家的帮助,总算是把MD学会了,但是关键是计算之后不知道怎么用Analysis,在此向大家请假Discover中的Analysis的具体用法,不甚感激!(我在用MD的时候用的是NPT系宗,我做的是有机分子在金属表面的吸附模拟,想分析些取向角,吸附角,有机分子的环质子到金属表面的距离什么的)

[ Last edited by gyldmy on 2011-10-4 at 15:51 ]
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倚天舰

木虫 (小有名气)

★ ★
zzy870720z(金币+2): 谢谢指教 2011-10-11 15:00:27
引用回帖:
3楼: Originally posted by gyldmy at 2011-10-10 08:54:38:
我想请问一下楼:要分析的角建立一个set是什么意思?能不能在具体点,不甚感激

你要分析哪个角度,就将哪个角选中,新建一个set,然后用键角分析。应该就能看到这个角度在md过程中的变化情况了
4楼2011-10-11 00:04:33
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倚天舰

木虫 (小有名气)

★ ★
zzy870720z(金币+2): 谢谢指点 2011-10-09 11:16:52
角度分析可以用structural里的angle distribution分析吧,需要先将你要分析的角建立一个set,然后分析
2楼2011-10-08 10:27:12
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gyldmy

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 倚天舰 at 2011-10-08 10:27:12:
角度分析可以用structural里的angle distribution分析吧,需要先将你要分析的角建立一个set,然后分析

我想请问一下楼:要分析的角建立一个set是什么意思?能不能在具体点,不甚感激
3楼2011-10-10 08:54:38
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