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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » MD结果的分析
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gyldmy

铜虫 (小有名气)

[求助] MD结果的分析

如题：本人初学MS，对MS知之甚少，老板要我学MD，自己琢磨加大家的帮助，总算是把MD学会了，但是关键是计算之后不知道怎么用Analysis，在此向大家请假Discover中的Analysis的具体用法，不甚感激！（我在用MD的时候用的是ＮＰＴ系宗，我做的是有机分子在金属表面的吸附模拟，想分析些取向角，吸附角，有机分子的环质子到金属表面的距离什么的）

[ Last edited by gyldmy on 2011-10-4 at 15:51 ]
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1楼 2011-10-04 14:47:52
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倚天舰

木虫 (小有名气)
★ ★
zzy870720z(金币+2): 谢谢指点 2011-10-09 11:16:52
角度分析可以用structural里的angle distribution分析吧，需要先将你要分析的角建立一个set，然后分析
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2楼2011-10-08 10:27:12
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gyldmy

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 倚天舰 at 2011-10-08 10:27:12:
角度分析可以用structural里的angle distribution分析吧，需要先将你要分析的角建立一个set，然后分析

我想请问一下楼：要分析的角建立一个set是什么意思？能不能在具体点，不甚感激
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3楼2011-10-10 08:54:38
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倚天舰

木虫 (小有名气)
★ ★
zzy870720z(金币+2): 谢谢指教 2011-10-11 15:00:27
引用回帖:
3楼: Originally posted by gyldmy at 2011-10-10 08:54:38:
我想请问一下楼：要分析的角建立一个set是什么意思？能不能在具体点，不甚感激

你要分析哪个角度，就将哪个角选中，新建一个set，然后用键角分析。应该就能看到这个角度在md过程中的变化情况了
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4楼2011-10-11 00:04:33
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