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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » vasp并行测试时出错。
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panjinbo87

木虫 (正式写手)

[求助] vasp并行测试时出错。

最近学习vasp并行编译，在并行测试（mpdrun -np 4 vasp > out&）时出错：vasp: error while loading shared libraries: libsvml.so: cannot open shared object file: No such file or directory。并且，四个核都在各跑各的，相当于用单核跑了四遍。
我用单核跑vasp能正常运行，vasp是用mpif90+libgoto编译的。我试着从ifort的lib库里面复制libsvml.so到vasp.lib中，但是运行后仍然是那个错误，没有成功。
不知道大家有没有遇到过这种情况？
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1楼2011-10-03 17:08:54
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匿名

用户注销 (正式写手)
★
uuv2010(金币+1): 欢迎参加交流 2011-10-03 21:23:21
panjinbo87(金币+5): 好的，非常感谢。我先试试，遇到问题再请教。 2011-10-03 21:40:23
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2楼2011-10-03 20:46:35
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panjinbo87

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by cell at 2011-10-03 20:46:35:
感觉是几个问题赶到一块了，首先是编译的时候出了问题，可能是goto库编译出错，也可能是编译器找不到lib文件，具体的需要你去检查，解决方法好像是在makefile文件里面加入lib文件的目录，可以参照
[url]http:// ...

我在.bashrc里面添加环境变量，LINK也没有问题，我重试了，还是会出现这种结果，不知道是什么问题。
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3楼2011-10-03 23:08:04
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匿名

用户注销 (正式写手)
★
uuv2010(金币+1): 多谢提示 2011-10-04 11:51:29
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4楼2011-10-04 06:47:03
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panjinbo87

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by cell at 2011-10-04 06:47:03:
你计算用的机器是单机还是集群，如果是集群，可能会出现节点机和主节点目录不相同的情况，这时候需要将节点机的路径设上。如果是单机，想不到其他办法。这个问题就是系统找不到文件，只要设置对了路径和文件，就 ...

我用的是集群，并了四台机器，四台机器之间设置了硬盘共享。我再用其他方法试试看，谢谢。
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5楼2011-10-04 09:18:38
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panjinbo87

木虫 (正式写手)
试了很多次，发现并行的四台机器中有一台上面确实找不到那个目录。三台机子并行，不会出现lib库了。但仍然还存在三台机器各跑各的问题。
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6楼2011-10-04 11:40:05
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panjinbo87

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by cell at 2011-10-04 06:47:03:
你计算用的机器是单机还是集群，如果是集群，可能会出现节点机和主节点目录不相同的情况，这时候需要将节点机的路径设上。如果是单机，想不到其他办法。这个问题就是系统找不到文件，只要设置对了路径和文件，就 ...

谢谢你的提示，我现在vasp并行编译通了，能够正常运行了。vasp_gama point单核的也编译通了，可是在编译vasp_gama的并行时还是有点问题。
CPP    = $(CPP_) -DMPI  -DHOST=\"LinuxIFC\" -DIFC \
     -Dkind8 -DNGZhalf -DCACHE_SIZE=4000 -DPGF90 -Davoidalloc \
     -DMPI_BLOCK=500  \
#    -DRPROMU_DGEMV  -DRACCMU_DGEMV
我想请问，CPP应该怎么改呢？
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7楼2011-10-04 14:53:45
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hnuzhoulin

金虫 (小有名气)
诶，好吧，，纯粹支持一下吧，，编译过很多次，，，但是真的都没有动过cpp这一项

找不到库文件的时候可以 用ldd查看所需的库文件在节点机上是否都有。
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8楼2011-10-21 20:34:33
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