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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】vasp并行出错
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SPRII

银虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】vasp并行出错 已有2人参与

各位虫友,大家好!我最近编绎了一个vasp的并行版本,能够编绎得到可执行程序,但运行时提示以下错误,
forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
Image              PC                Routine            Line        Source            
vaspmpi            00000000006717AA  Unknown               Unknown  Unknown
vaspmpi            0000000000663D99  Unknown               Unknown  Unknown
vaspmpi            0000000000649BB2  Unknown               Unknown  Unknown
vaspmpi            00000000006499B8  Unknown               Unknown  Unknown
vaspmpi            000000000041D536  Unknown               Unknown  Unknown
vaspmpi            000000000040787C  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003B1C81D994  Unknown               Unknown  Unknown
vaspmpi            0000000000407789  Unknown               Unknown  Unknown

另在网上查了一下相关问题的解决方法,如ulimit -s unlimited等,但最终运行vasp时还是提示以上问题,不知怎样解决,希望大家帮忙!
先谢过!
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1楼 2010-12-08 12:15:52
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zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)

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★
ellsaking(金币+1):谢谢回复~ 2010-12-08 12:32:51
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2158871
侯老师给予解答
引用回帖:
可能是ifort 11的问题。在FLAG的选项中加入: -heap-arrays  64试试看。

请善于利用站内搜索
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博学、审问、慎思、明辨、笃学
2楼2010-12-08 12:23:45
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SPRII

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2010-12-08 12:23:45:
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2158871
侯老师给予解答

请善于利用站内搜索

首先,谢谢你的回答!
你提到的解法方法我已经试过了,还是不能用,怎么办?
我的环境是: RHEL 5.5 + ifort 11+ Gotoblas+ fftw + mpich

[ Last edited by SPRII on 2010-12-9 at 01:37 ]
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3楼2010-12-09 01:35:12
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zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)

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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
youzhizhe(金币+1):谢谢交流。 2010-12-09 10:39:18
引用回帖:
Originally posted by SPRII at 2010-12-09 01:35:12:


首先,谢谢你的回答!
你提到的解法方法我已经试过了,还是不能用,怎么办?
我的环境是: RHEL 5.5 + ifort 11+ Gotoblas+ fftw + mpich

[ Last edited by SPRII on 2010-12-9 at 01:37 ]

你计算多大体系，机器配置如何
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博学、审问、慎思、明辨、笃学
4楼2010-12-09 07:57:15
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SPRII

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2010-12-09 07:57:15:

你计算多大体系，机器配置如何

计算体系很小,仅两个原子!
机器:dell 980, cpu: intel i7;
情况很奇怪啊,串行的完全可以正常运行,但就是并行不行,几乎连优化电子的循环都进不去,直接提示"vasp forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred";
有人说是ifort 11或mpich的问题,我都试着重新编绎了N多次,但并行就是通不过....
PS: 我是通过SSH远程安装的.
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5楼2010-12-09 10:06:11
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zzy870720z

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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
youzhizhe(金币+1):谢谢提示。 2010-12-09 10:39:32
引用回帖:
Originally posted by SPRII at 2010-12-09 10:06:11:


计算体系很小,仅两个原子!
机器:dell 980, cpu: intel i7;
情况很奇怪啊,串行的完全可以正常运行,但就是并行不行,几乎连优化电子的循环都进不去,直接提示"vasp forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmen ...

那还真不清楚，应该是编译的问题，换个ifort版本试试
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博学、审问、慎思、明辨、笃学
6楼2010-12-09 10:33:55
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