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太白击剑

铁杆木虫 (正式写手)


[交流] 【求助】VASP求助

在使用VASP计算能带的时候总是会出错,提示如下:
p4_error: interrupt SIGSEGV: 11
无论是使用服务器并行计算的还是单核计算都会出错,该如何解决?谢谢
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xiaoxiao6726

银虫 (初入文坛)



bingmou(金币+1): 感谢交流。 2011-03-23 11:01:13
呵呵,我也是刚开始学VASP,最初用了网上的一个例子,可能比较复杂,也总是出现段错误,在网上查了半天,没有搞清楚具体是什么问题导致的,只知道可能是由于ifort软件,或者数据库的问题。后来换了简单一点的例子开始计算,发现没有问题。
2楼2011-03-23 10:16:58
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xiaoxiao6726

银虫 (初入文坛)



gzqdyouxia(金币+1): 谢谢交流 2011-03-25 11:57:29
我用的编译器是ifort,数据库是mkl,最初用网上的例子进行单原子计算,会出现段错误,后来改用简单的例子进行计算发现这个问题就没有了,最近又进行单原子计算,发现只要用ulimit -s unlimited修改一下就可以正常运行了。我觉得有可能是你的具体计算文件设置导致的段错误,呵呵,一家之言
3楼2011-03-25 11:02:05
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enola

捐助贵宾 (正式写手)



gzqdyouxia(金币+1): 谢谢交流 2011-03-25 11:57:36
引用回帖:
Originally posted by 太白击剑 at 2011-03-19 15:55:51:
在使用VASP计算能带的时候总是会出错,提示如下:
p4_error: interrupt SIGSEGV: 11
无论是使用服务器并行计算的还是单核计算都会出错,该如何解决?谢谢

ulimit -s unlimited
尝试下这个
ulimit -a 用来显示当前的各种用户进程限制。
Linux对于每个用户,系统限制其最大进程数。为提高性能,可以根据设备资源情况,
设置各linux 用户的最大进程数,下面我把某linux用户的最大进程数设为10000个:
ulimit -u 10000
对于需要做许多 socket 连接并使它们处于打开状态的 Java 应用程序而言,
最好通过使用 ulimit -n xx 修改每个进程可打开的文件数,缺省值是 1024。
ulimit -n 4096 将每个进程可以打开的文件数目加大到4096,缺省为1024
其他建议设置成无限制(unlimited)的一些重要设置是:
数据段长度:ulimit -d unlimited
最大内存大小:ulimit -m unlimited
堆栈大小:ulimit -s unlimited
CPU 时间:ulimit -t unlimited
虚拟内存:ulimit -v unlimited
4楼2011-03-25 11:12:15
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fengya0785

银虫 (小有名气)



gzqdyouxia(金币+1): 谢谢交流 2011-03-25 11:57:43
我能看看你编译vasp时所link的库么?最好你把Makefile发上来。然后你们服务器的cpu类型。

这种段错误可能出错的地方其实挺多的。要具体定位原因才行。
5楼2011-03-25 11:26:25
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gzqdyouxia(金币+1): 谢谢交流 2011-03-25 18:51:34
引用回帖:
Originally posted by 太白击剑 at 2011-03-19 15:55:51:
在使用VASP计算能带的时候总是会出错,提示如下:
p4_error: interrupt SIGSEGV: 11
无论是使用服务器并行计算的还是单核计算都会出错,该如何解决?谢谢

我感觉是内存的问题 或者编译的问题。在跑的时候你关注一下内存的的情况
6楼2011-03-25 13:42:04
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