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wang-lf09

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】vasp运行问题 已有4人参与

vasp已经安装完成,但用mpirun -np 4 /usr/local/vasp.4.6/vasp-goto-p运行的时候,怎么出现以下错误呢?

[[27091,1],1]: A high-performance Open MPI point-to-point messaging module
was unable to find any relevant network interfaces:

Module: OpenFabrics (openib)
  Host: localhost.localdomain

Another transport will be used instead, although this may result in
lower performance.
--------------------------------------------------------------------------
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
--------------------------------------------------------------------------
mpirun has exited due to process rank 3 with PID 24871 on
node localhost.localdomain exiting without calling "finalize". This may
have caused other processes in the application to be
terminated by signals sent by mpirun (as reported here).
--------------------------------------------------------------------------
[localhost.localdomain:24867] 3 more processes have sent help message help-mpi-btl-base.txt / btl:no-nics
[localhost.localdomain:24867] Set MCA parameter "orte_base_help_aggregate" to 0 to see all help / error messages

本人菜鸟,求高手帮忙!不胜感激……
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zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)

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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
几个节点?提示说没有网络设备(relevant network interfaces)
博学、审问、慎思、明辨、笃学
2楼2010-05-03 16:48:50
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wang-lf09

木虫 (小有名气)

想实现4核并行运算,不知道是节点之间没法连接还是怎么回事。但是用mpirun -np 1…也是不行的,真不知道为什么。
哪位大侠能出手相助、指条明路啊!小弟在此先谢啦!
3楼2010-05-03 20:14:17
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luxia0210

铁杆木虫 (著名写手)

GG


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
mpirun -n 4 /usr/local/vasp.4.6/vasp-goto-p &
这样就好,不过你的先编译好你的并行环境
潜心百年,为求一败!
4楼2010-05-03 23:54:51
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luxia0210

铁杆木虫 (著名写手)

GG

★ ★ ★
xiaohunhun(金币+3):谢谢 2010-05-04 12:22
还有一个问题就是你的IMAGES参数是如何设置的,不能超过四,因为你的最多也就是四核,你IMAGES设的是几,mpirun -n 4 /usr/local/vasp.4.6/vasp-goto-p & 这个里面的数字就是IMAGES那个参数的整数倍
潜心百年,为求一败!
5楼2010-05-03 23:56:49
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wang-lf09

木虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by luxia0210 at 2010-05-03 23:56:49:
还有一个问题就是你的IMAGES参数是如何设置的,不能超过四,因为你的最多也就是四核,你IMAGES设的是几,mpirun -n 4 /usr/local/vasp.4.6/vasp-goto-p & 这个里面的数字就是IMAGES那个参数的整数倍

我刚学着用,对Linux和vasp都不熟,再请问IMAGES参数在哪设置呢?我用的是从别人那拷过来的例子,对里面是什么全然不知。
谢谢你啊!
6楼2010-05-04 09:13:55
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luxia0210

铁杆木虫 (著名写手)

GG

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
xiaohunhun(金币+3):xiexie 2010-05-04 18:38:16
引用回帖:
Originally posted by wang-lf09 at 2010-05-04 09:13:55:



我刚学着用,对Linux和vasp都不熟,再请问IMAGES参数在哪设置呢?我用的是从别人那拷过来的例子,对里面是什么全然不知。
谢谢你啊!

首先你要知道IMAGES是干什么的啊,这个是你计算离子的路径问题的,如果你只是计算一系诶体相的态密度和能带的问题,就不要设这个参数,如果你要计算活化能或者是迁移路径问题的就看你中间取几个点就设为几,具体参照手册NEB method,那里有详细的说明
潜心百年,为求一败!
7楼2010-05-04 12:46:55
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ilnectar

铜虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主您好,看到你的问题已是好久好久之后的现在,不知道您的问题解决了没有。我也是刚开始用linux和VASP,也遇到一样的报错。请问一下VASP这方面的高手,到底是哪里设置不正确才会出现more processes have sent help message help-mpi-btl-base.txt / btl:no-nics 以及Set MCA parameter "orte_base_help_aggregate" to 0 to see all help / error messages的报错消息。
8楼2015-12-02 03:58:04
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