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panjinbo87

木虫 (正式写手)

[求助] vasp并行测试时出错。

最近学习vasp并行编译,在并行测试(mpdrun -np 4 vasp > out&)时出错:vasp: error while loading shared libraries: libsvml.so: cannot open shared object file: No such file or directory。并且,四个核都在各跑各的,相当于用单核跑了四遍。
我用单核跑vasp能正常运行,vasp是用mpif90+libgoto编译的。我试着从ifort的lib库里面复制libsvml.so到vasp.lib中,但是运行后仍然是那个错误,没有成功。
不知道大家有没有遇到过这种情况?
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匿名

用户注销 (正式写手)


uuv2010(金币+1): 欢迎参加交流 2011-10-03 21:23:21
panjinbo87(金币+5): 好的,非常感谢。我先试试,遇到问题再请教。 2011-10-03 21:40:23
本帖仅楼主可见
2楼2011-10-03 20:46:35
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panjinbo87

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cell at 2011-10-03 20:46:35:
感觉是几个问题赶到一块了,首先是编译的时候出了问题,可能是goto库编译出错,也可能是编译器找不到lib文件,具体的需要你去检查,解决方法好像是在makefile文件里面加入lib文件的目录,可以参照
[url]http:// ...

我在.bashrc里面添加环境变量,LINK也没有问题,我重试了,还是会出现这种结果,不知道是什么问题。
3楼2011-10-03 23:08:04
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匿名

用户注销 (正式写手)


uuv2010(金币+1): 多谢提示 2011-10-04 11:51:29
本帖仅楼主可见
4楼2011-10-04 06:47:03
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panjinbo87

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by cell at 2011-10-04 06:47:03:
你计算用的机器是单机还是集群,如果是集群,可能会出现节点机和主节点目录不相同的情况,这时候需要将节点机的路径设上。如果是单机,想不到其他办法。这个问题就是系统找不到文件,只要设置对了路径和文件,就 ...

我用的是集群,并了四台机器,四台机器之间设置了硬盘共享。我再用其他方法试试看,谢谢。
5楼2011-10-04 09:18:38
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panjinbo87

木虫 (正式写手)

试了很多次,发现并行的四台机器中有一台上面确实找不到那个目录。三台机子并行,不会出现lib库了。但仍然还存在三台机器各跑各的问题。
6楼2011-10-04 11:40:05
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panjinbo87

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by cell at 2011-10-04 06:47:03:
你计算用的机器是单机还是集群,如果是集群,可能会出现节点机和主节点目录不相同的情况,这时候需要将节点机的路径设上。如果是单机,想不到其他办法。这个问题就是系统找不到文件,只要设置对了路径和文件,就 ...

谢谢你的提示,我现在vasp并行编译通了,能够正常运行了。vasp_gama point单核的也编译通了,可是在编译vasp_gama的并行时还是有点问题。
CPP    = $(CPP_) -DMPI  -DHOST=\"LinuxIFC\" -DIFC \
     -Dkind8 -DNGZhalf -DCACHE_SIZE=4000 -DPGF90 -Davoidalloc \
     -DMPI_BLOCK=500  \
#    -DRPROMU_DGEMV  -DRACCMU_DGEMV
我想请问,CPP应该怎么改呢?
7楼2011-10-04 14:53:45
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hnuzhoulin

金虫 (小有名气)

诶,好吧,,纯粹支持一下吧,,编译过很多次,,,但是真的都没有动过cpp这一项

找不到库文件的时候可以 用ldd查看所需的库文件在节点机上是否都有。
8楼2011-10-21 20:34:33
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