应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 求助TRFLP数据分析
51/1返回列表
查看: 3632  |  回复: 17
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

bamboozhb

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-09-27 23:18:22
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jerryzyy

金虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by kingleo99 at 2013-05-20 16:08:01
你好，三次重复是为了尽可能的将测序误差和酶切误差降到最低点。如果三次误差非常小（比如就是几个峰的有无这样差异）那么挑选一个峰多的去做或者其中任何一个都可以，如果三次重复差异太大了那么考虑重新做。三次 ...

你好，如果我要做主成分分析的话，T-RFs之间相差多少可以被认为是一条带。另外，我如果做多样性分析的话，比如说丰富性什么的，需不需要先将相似的条带归为一类再做。在线比对的时候需不需要呢?
赞一下(1人) 回复此楼
9楼2013-08-21 08:31:15
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 18 个回答

kingleo99

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

bamboozhb(金币+10): 谢谢你了，我先看看这些文献，你说的关于T-RFLP分析的文件主要是那些呢，我在网上找了好久没有找到，你是否可以给指点一些呢，万分感激！ 2011-09-28 14:13:46
第一个图中横坐标表示TRFs或者峰（酶切后带荧光的那段）的片段大小，纵坐标表示荧光强度。第二个表格中是详细的峰所对应的片段大小，峰高，峰面积。一般用于分析主要使用的是峰面积。建议你多看看一些关于T-RFLP分析的文件，推荐个文献你看看《Statistical methods for characterizing diversity of microbial communities by analysis of terminal restriction fragment length polymorphisms of 16S rRNA genes》《 Evaluation of terminal-restrictionfragment length polymorphism analysis in contrastingmarine environments》
赞一下(1人) 回复此楼
科学就是发现规律，而规律是上帝创造的，认识独一上帝就是智慧。
2楼2011-09-28 11:52:26
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kingleo99

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

bamboozhb(金币+60): 谢谢你了，经过你的指点，感觉对这个东西有一点了解了。 2011-09-28 16:11:17
T-RFLP技术主要需要分析的有，计算各种多样性指数，还可以做聚类分析（如果你的样本不是只有一个的话），CCA分析。另外，可以将你的条带信息，整理好提交到MICA网站上进行在线比对，从而确定你的那些峰所代表的具体为那个门类的微生物，基本可以确定到属的分类水平。这些分析都在文献中有。祝你好运
赞一下 回复此楼
科学就是发现规律，而规律是上帝创造的，认识独一上帝就是智慧。
3楼2011-09-28 16:07:34
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chais

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by kingleo99 at 2011-09-28 16:07:34:
T-RFLP技术主要需要分析的有，计算各种多样性指数，还可以做聚类分析（如果你的样本不是只有一个的话），CCA分析。另外，可以将你的条带信息，整理好提交到MICA网站上进行在线比对，从而确定你的那些峰所代表的具 ...

请问提交到mica上的“条带信息”格式是怎么样的？
赞一下 回复此楼
4楼2011-11-29 21:27:25
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 18 个回答
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 330求调剂0854 +3 assdll 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:01 by 搏击518
[考研] 材料学学硕080502 337求调剂-一志愿华中科技大学 +4 顺顺顺mr 2026-03-18 5/250 2026-03-21 10:22 by luoyongfeng
[考研] 一志愿山大07化学 332分 四六级已过 本科山东双非 求调剂！ +3 不想理你 2026-03-16 3/150 2026-03-21 03:59 by JourneyLucky
[考研] 299求调剂 +6 △小透明* 2026-03-17 6/300 2026-03-21 02:42 by JourneyLucky
[考研] 083200学硕321分一志愿暨南大学求调剂 +3 innocenceF 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:35 by JourneyLucky
[考研] 初始318分求调剂（有工作经验） +3 1911236844 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:33 by JourneyLucky
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境专硕，总分308求调剂 +3 墨墨漠 2026-03-18 3/150 2026-03-21 00:39 by JourneyLucky
[考研] 304求调剂 +6 曼殊2266 2026-03-18 6/300 2026-03-21 00:32 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西南交大，求调剂 +5 材化逐梦人 2026-03-18 5/250 2026-03-21 00:26 by JourneyLucky
[考研] 求调剂，一志愿:南京航空航天大学大学 ，080500材料科学与工程学硕，总分289分 +4 @taotao 2026-03-19 4/200 2026-03-20 22:14 by JourneyLucky
[考研] 295材料求调剂，一志愿武汉理工085601专硕 +5 Charlieyq 2026-03-19 5/250 2026-03-20 20:35 by JourneyLucky
[考研] 梁成伟老师课题组欢迎你的加入 +9 一鸭鸭哟 2026-03-14 11/550 2026-03-19 17:22 by ！本暗一次！
[考研] 286求调剂 +6 lemonzzn 2026-03-16 10/500 2026-03-19 14:31 by lemonzzn
[考研] 085600材料与化工求调剂 +6 绪幸与子 2026-03-17 6/300 2026-03-19 13:27 by houyaoxu
[考研] 085601专硕，总分342求调剂，地区不限 +5 share_joy 2026-03-16 5/250 2026-03-18 14:48 by haxia
[考研] 0854，计算机类招收调剂 +3 胡辣汤放糖 2026-03-15 6/300 2026-03-18 12:09 by 上岸上岸……..
[考博] 26博士申请 +3 1042136743 2026-03-17 3/150 2026-03-17 23:30 by 轻松不少随
[考研] 一志愿，福州大学材料专硕339分求调剂 +3 木子momo青争 2026-03-15 3/150 2026-03-17 07:52 by laoshidan
[考研] 321求调剂 +5 大米饭！ 2026-03-15 5/250 2026-03-16 16:33 by houyaoxu
[考研] 本科南京大学一志愿川大药学327 +3 麦田耕者 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:04 by 外星文明
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭