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bamboozhb

禁虫 (小有名气)
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1楼 2011-09-27 23:18:22
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jerryzyy

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by kingleo99 at 2011-09-28 16:07:34
T-RFLP技术主要需要分析的有，计算各种多样性指数，还可以做聚类分析（如果你的样本不是只有一个的话），CCA分析。另外，可以将你的条带信息，整理好提交到MICA网站上进行在线比对，从而确定你的那些峰所代表的具体 ...

你好，如果每个样品做了3次重复，在线比对的时候该怎么比对，是3个重复都比对吗，还是只挑一个比对就可以了。
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7楼2013-05-20 08:33:54
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jerryzyy

金虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by kingleo99 at 2013-05-20 16:08:01
你好，三次重复是为了尽可能的将测序误差和酶切误差降到最低点。如果三次误差非常小（比如就是几个峰的有无这样差异）那么挑选一个峰多的去做或者其中任何一个都可以，如果三次重复差异太大了那么考虑重新做。三次 ...

你好，如果我要做主成分分析的话，T-RFs之间相差多少可以被认为是一条带。另外，我如果做多样性分析的话，比如说丰富性什么的，需不需要先将相似的条带归为一类再做。在线比对的时候需不需要呢?
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9楼2013-08-21 08:31:15
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