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shaquila

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[交流] 帮忙鉴定下这个水稻叶片RNA怎么回事? 已有2人参与

跑电泳有点奇怪,普通1%琼脂糖电泳,220v 10分钟
顶上那条代应该是28s,但是为什么那么细,别人说可能是基因组,但是基因组应该是很粗的,不会这么单一,做PCR没有跑出基因组条带,不过18s比较浓,和28s不成比例,后来又跑了一次,发现貌似是和别的RNA粘在一起,另外,,看不见5s,听说水稻叶片RNA比较多带,这样正常吗?

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1楼 2011-09-24 11:56:08

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shaquila

金虫 (正式写手)

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怀疑有可能是DNA,后来又跑了一次
第一个是我随机抽取的一个样,后一个是同学提的用于基因芯片的RNA
发现那条应该不是DNA,而是25s,下面可能是18S和16S混在一起的?

附上两张文章里面的图,右边的L和M分别是幼叶和老叶

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3楼2011-09-27 12:09:59

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poog502

木虫 (正式写手)

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西瓜(金币+4): 分析得很好！ 2011-09-26 13:20:29
西瓜(金币+4): 分析得很好！ 2011-09-26 13:20:31
西瓜(金币-4): 网络问题给重复了，撤回4金币。抱歉！ 2011-09-27 13:39:23

顶上哪条带是残余的基因组DNA污染，所提取的RNA质量还可以，28S是18S的约两倍，表明RNA降解很很少，可以满足反转录PCR的需要。如果做qRT-PCR或Real-time PCR需要继续去除残余的DNA污染。5S哪条带没有表明一、可能降解了；二可能是浓度太低所致。
总体是正常的。可以放心使用。

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2楼2011-09-26 08:40:48

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