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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 如何查询某个基因片段的甲基化位点
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bdchengli

木虫 (小有名气)

[求助] 如何查询某个基因片段的甲基化位点

刚开始做甲基化，想要一段甲基化的基因序列，如何才能查询出某个基因序列并且知道甲基化的位点，求详细讲解过程
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1楼 2011-09-20 17:07:22
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
dhd997(金币+5, MolEPI+1): 2011-09-21 07:51:53
bdchengli(金币+5): 2011-09-21 20:25:53
这样吧，给你发个文献，自己看看（本人不是搞这一行的，无法说）！里面介绍了 DNA甲基化数据库以及一个预测甲基化位点的生物信心学工具！
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真相是最大的奢侈品
2楼2011-09-20 22:15:26
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bdchengli

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wanhscn at 2011-09-20 22:15:26:
这样吧，给你发个文献，自己看看（本人不是搞这一行的，无法说）！里面介绍了 DNA甲基化数据库以及一个预测甲基化位点的生物信心学工具！

不全，这篇文献就一页啊，再传一遍吧
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3楼2011-09-21 10:43:06
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liweiwei0812

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
wanhscn(金币+1): 鼓励应助！ 2011-09-21 14:15:58
可以用MethPrimer在线预测甲基化位点，把你感兴趣的序列输入进去就可以了，每次5kb，在用BSP方法直接找到甲基化位点。
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4楼2011-09-21 11:21:29
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根
引用回帖:
3楼: Originally posted by bdchengli at 2011-09-21 10:43:06:
不全，这篇文献就一页啊，再传一遍吧

我重新下了那个链接，在我电脑里面是全的，共22页！
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真相是最大的奢侈品
5楼2011-09-21 14:11:03
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bdchengli

木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by liweiwei0812 at 2011-09-21 11:21:29:
可以用MethPrimer在线预测甲基化位点，把你感兴趣的序列输入进去就可以了，每次5kb，在用BSP方法直接找到甲基化位点。

MethPrimer在线预测,
For display, assume all CpG sites are methylated
这也没什么意义吧？？  CpG 都默认甲基化了。我是要先选好目标链再设计实验方法去检测的。之后应该是会用BSP来验证方法的可靠性。现在是要先把目标链选好，我必须知道甲基化位点。 你了解MethDB吗？是不是这个可以？
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6楼2011-09-21 14:56:55
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7楼2012-10-24 22:42:46
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