应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 如何获取力场参数文件？
51/1返回列表
查看: 2824  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

jj2006

木虫 (小有名气)

[求助] 如何获取力场参数文件？

如题，我在用amber做MD时遇到了非标准原子SI，貌似amber力场和charmm立场里面都没有相关的立场参数，现在需要补全参数，请问各位大虾如何获取相关参数？不胜感激！（p.s. 我也试着检索了大量文献，对应的键长，角度什么的基本补全，但是对应的constant却不得而知......）
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
it‘snottimetomakeadecision，it'stimetomakemistakes！
1楼 2011-09-08 20:33:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (正式写手)
★ ★
jj2006(金币+5): thanks！ 2011-09-10 10:29:42
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-09-13 07:40:05
本帖仅楼主可见
赞一下
2楼2011-09-09 15:39:48
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

jj2006

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 小蜗牛8728 at 2011-09-09 15:39:48:
SI是什么原子呢？如果找不到力场参数的话，可以去amber官方网站，和他们取得联系吧。ps：偶小老板是amber的developer之一哦，有时间的话我可以帮你问问。

硅原子，貌似这个原子现在用得不是很多，所以立场参数很难找，查阅了很多文献，只补全了一部分！
赞一下 回复此楼
it‘snottimetomakeadecision，it'stimetomakemistakes！
3楼2011-09-10 10:31:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (正式写手)
本帖仅楼主可见
赞一下
4楼2011-09-10 10:55:31
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

紫薇愿

木虫 (正式写手)
楼主，我是个初学者，请问怎么获取N的力场参数啊？不胜感激
赞一下 回复此楼
5楼2014-11-27 09:02:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 jj2006 的主题更新
51/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭