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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 如何获取力场参数文件？
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jj2006

木虫 (小有名气)

[求助] 如何获取力场参数文件？

如题，我在用amber做MD时遇到了非标准原子SI，貌似amber力场和charmm立场里面都没有相关的立场参数，现在需要补全参数，请问各位大虾如何获取相关参数？不胜感激！（p.s. 我也试着检索了大量文献，对应的键长，角度什么的基本补全，但是对应的constant却不得而知......）
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it‘snottimetomakeadecision，it'stimetomakemistakes！
1楼 2011-09-08 20:33:31
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匿名

用户注销 (正式写手)
★ ★
jj2006(金币+5): thanks！ 2011-09-10 10:29:42
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-09-13 07:40:05
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2楼2011-09-09 15:39:48
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jj2006

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 小蜗牛8728 at 2011-09-09 15:39:48:
SI是什么原子呢？如果找不到力场参数的话，可以去amber官方网站，和他们取得联系吧。ps：偶小老板是amber的developer之一哦，有时间的话我可以帮你问问。

硅原子，貌似这个原子现在用得不是很多，所以立场参数很难找，查阅了很多文献，只补全了一部分！
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it‘snottimetomakeadecision，it'stimetomakemistakes！
3楼2011-09-10 10:31:48
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匿名

用户注销 (正式写手)
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4楼2011-09-10 10:55:31
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紫薇愿

木虫 (正式写手)
楼主，我是个初学者，请问怎么获取N的力场参数啊？不胜感激
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5楼2014-11-27 09:02:28
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