24小时热门版块排行榜    

查看: 2614  |  回复: 4

jj2006

木虫 (小有名气)

[求助] 如何获取力场参数文件?

如题,我在用amber做MD时遇到了非标准原子SI,貌似amber力场和charmm立场里面都没有相关的立场参数,现在需要补全参数,请问各位大虾如何获取相关参数?不胜感激!(p.s. 我也试着检索了大量文献,对应的键长,角度什么的基本补全,但是对应的constant却不得而知......)
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

it‘snottimetomakeadecision,it'stimetomakemistakes!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (正式写手)

★ ★
jj2006(金币+5): thanks! 2011-09-10 10:29:42
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-09-13 07:40:05
本帖仅楼主可见
2楼2011-09-09 15:39:48
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

jj2006

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 小蜗牛8728 at 2011-09-09 15:39:48:
SI是什么原子呢?如果找不到力场参数的话,可以去amber官方网站,和他们取得联系吧。ps:偶小老板是amber的developer之一哦,有时间的话我可以帮你问问。

硅原子,貌似这个原子现在用得不是很多,所以立场参数很难找,查阅了很多文献,只补全了一部分!
it‘snottimetomakeadecision,it'stimetomakemistakes!
3楼2011-09-10 10:31:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (正式写手)

本帖仅楼主可见
4楼2011-09-10 10:55:31
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

紫薇愿

木虫 (正式写手)

楼主,我是个初学者,请问怎么获取N的力场参数啊?不胜感激
5楼2014-11-27 09:02:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 jj2006 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 352求调剂 +3 大米饭! 2026-03-22 3/150 2026-03-22 23:28 by king123!
[考研] 310求调剂 +4 baibai1314 2026-03-16 4/200 2026-03-22 20:19 by edmund7
[考研] 招08考数学 +4 laoshidan 2026-03-20 8/400 2026-03-22 19:56 by 小皮蛋酱
[考研] 环境学硕288求调剂 +6 皮皮皮123456 2026-03-22 6/300 2026-03-22 16:52 by i_cooler
[考研] 289求调剂 +7 怀瑾握瑜l 2026-03-20 7/350 2026-03-22 15:57 by ColorlessPI
[考研] 298求调剂一志愿211 +3 上岸6666@ 2026-03-20 3/150 2026-03-22 15:50 by ColorlessPI
[考研] 085600材料与化工306 +4 z1z2z3879 2026-03-21 4/200 2026-03-21 23:44 by ms629
[考研] 333求调剂 +5 87639 2026-03-21 7/350 2026-03-21 19:31 by ColorlessPI
[考研] 307求调剂 +3 余意卿 2026-03-18 3/150 2026-03-21 17:31 by ColorlessPI
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境总分308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-20 7/350 2026-03-21 16:36 by barlinike
[考研] 303求调剂 +5 睿08 2026-03-17 7/350 2026-03-21 03:11 by JourneyLucky
[考研] 299求调剂 +6 △小透明* 2026-03-17 6/300 2026-03-21 02:42 by JourneyLucky
[考研] 二本跨考郑大材料306英一数二 +3 z1z2z3879 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:29 by JourneyLucky
[考研] 材料 336 求调剂 +3 An@. 2026-03-18 4/200 2026-03-21 01:39 by JourneyLucky
[考研] 304求调剂 +6 曼殊2266 2026-03-18 6/300 2026-03-21 00:32 by JourneyLucky
[考研] 一志愿武汉理工材料工程专硕调剂 +9 Doleres 2026-03-19 9/450 2026-03-20 22:36 by JourneyLucky
[考研] 材料学硕297已过四六级求调剂推荐 +11 adaie 2026-03-19 11/550 2026-03-20 21:30 by laoshidan
[考研] 一志愿西南交通 专硕 材料355 本科双非 求调剂 +5 西南交通专材355 2026-03-19 5/250 2026-03-20 21:10 by JourneyLucky
[考研] 考研求调剂 +3 橘颂. 2026-03-17 4/200 2026-03-17 21:43 by 有只狸奴
[考研] 一志愿南京大学,080500材料科学与工程,调剂 +4 Jy? 2026-03-16 4/200 2026-03-17 11:02 by gaoqiong
信息提示
请填处理意见