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jj2006

木虫 (小有名气)

[求助] 如何获取力场参数文件?

如题,我在用amber做MD时遇到了非标准原子SI,貌似amber力场和charmm立场里面都没有相关的立场参数,现在需要补全参数,请问各位大虾如何获取相关参数?不胜感激!(p.s. 我也试着检索了大量文献,对应的键长,角度什么的基本补全,但是对应的constant却不得而知......)
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匿名

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4楼2011-09-10 10:55:31
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匿名

用户注销 (正式写手)

★ ★
jj2006(金币+5): thanks! 2011-09-10 10:29:42
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-09-13 07:40:05
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2楼2011-09-09 15:39:48
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jj2006

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 小蜗牛8728 at 2011-09-09 15:39:48:
SI是什么原子呢?如果找不到力场参数的话,可以去amber官方网站,和他们取得联系吧。ps:偶小老板是amber的developer之一哦,有时间的话我可以帮你问问。

硅原子,貌似这个原子现在用得不是很多,所以立场参数很难找,查阅了很多文献,只补全了一部分!
it‘snottimetomakeadecision,it'stimetomakemistakes!
3楼2011-09-10 10:31:48
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紫薇愿

木虫 (正式写手)

楼主,我是个初学者,请问怎么获取N的力场参数啊?不胜感激
5楼2014-11-27 09:02:28
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