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如何得到已知蛋白序列的对应的基因序列
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biozlmer
铁虫
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虫号: 704540
注册: 2009-02-20
性别: GG
专业: 微生物遗传育种学
[
求助
]
如何得到已知蛋白序列的对应的基因序列
我手上现在有一株酵母工程菌,只知道这个质粒表达的蛋白序列,但是我想知道对应的目的蛋白编码基因序列,本来是有这个资料的,但是丢失了,请问如何得到?并且我要用这个基因序列设计引物,从而把这段序列P出来,所以不好直接用软件翻译蛋白序列为基因序列。求助各位~~~
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1楼
2011-09-05 15:04:23
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楚姬
新虫
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注册: 2013-08-30
引用回帖:
6楼
:
Originally posted by
xt123xt
at 2011-09-07 14:44:39
http://www.expasy.org/tools/blast/
输入氨基酸序列
run blast
waiting。。。
往下拉
找到 100%Identities的那个
点左上角链接进入
Sequence databases里的就是
点链接进去
最下面就是 ...
找不到100%Identities的,大多数都是70-80,90以上的都找不到
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9楼
2013-11-11 09:29:44
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带刀猎人
新虫
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专业: 微生物生理与生物化学
【答案】应助回帖
设计引物P出来测序,这是最稳妥的,翻译软件翻译由于密码子的简并性,不准确的!
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2楼
2011-09-05 17:14:32
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yguang
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注册: 2009-02-05
专业: 微生物遗传育种学
【答案】应助回帖
提质粒,质粒的序列是已知的吧,拿质粒上的通用引物测序就行了!
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3楼
2011-09-05 17:31:19
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banana08162707
铁虫
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注册: 2008-12-20
专业: 微生物遗传育种学
【答案】应助回帖
既然是工程菌,网上关于该酵母的资料会有的呀。找到你目的蛋白的上下游序列,把你的目的序列P出来。要不你可以把你的工程菌名称告诉我,我帮你查查看。
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4楼
2011-09-05 22:46:05
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