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biozlmer

铁虫 (初入文坛)

[求助] 如何得到已知蛋白序列的对应的基因序列

我手上现在有一株酵母工程菌,只知道这个质粒表达的蛋白序列,但是我想知道对应的目的蛋白编码基因序列,本来是有这个资料的,但是丢失了,请问如何得到?并且我要用这个基因序列设计引物,从而把这段序列P出来,所以不好直接用软件翻译蛋白序列为基因序列。求助各位~~~
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xt123xt

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

biozlmer(金币+5): 这个网站不错,谢谢啦 2011-09-08 19:40:49
http://www.expasy.org/tools/blast/

输入氨基酸序列

run blast

waiting。。。

往下拉

找到 100%Identities的那个

点左上角链接进入

Sequence databases里的就是

点链接进去

最下面就是核酸序列(注意CDS)
6楼2011-09-07 14:44:39
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带刀猎人

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

设计引物P出来测序,这是最稳妥的,翻译软件翻译由于密码子的简并性,不准确的!
2楼2011-09-05 17:14:32
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yguang

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

提质粒,质粒的序列是已知的吧,拿质粒上的通用引物测序就行了!
3楼2011-09-05 17:31:19
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banana08162707

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

既然是工程菌,网上关于该酵母的资料会有的呀。找到你目的蛋白的上下游序列,把你的目的序列P出来。要不你可以把你的工程菌名称告诉我,我帮你查查看。
4楼2011-09-05 22:46:05
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