24小时热门版块排行榜    

查看: 3278  |  回复: 10

临风7071

木虫 (正式写手)

[求助] 蛋白质三维结构预测

本人最近做蛋白,想看一下蛋白突变后的空间结构,即wild type和mutant的三维结构,哪位大侠有好的蛋白质结构预测网站推荐的啊?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

blackrose8089

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
临风7071(金币+2): 感谢!!! 2011-09-04 18:17:48
西瓜(金币+2): Good 2011-09-04 18:58:16
I-TASSER : http://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/I-TASSER/    楼主看下这个能不能用得上!提交的人较多,需要排队!一般两天之内可以返回!
jiayoubashaonian
2楼2011-09-04 17:05:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aayqaa

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
临风7071(金币+1): 2011-09-04 19:54:59
西瓜(金币+1): 鼓励应助 2012-01-11 16:03:18
swiss-model 也挺好用,可以试试看
3楼2011-09-04 19:53:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

临风7071

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by aayqaa at 2011-09-04 19:53:49:
swiss-model 也挺好用,可以试试看

怎么用啊?今天看了一下,不会用,找不到输入序列的地方
4楼2011-09-04 19:54:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aayqaa

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

临风7071(金币+1): xiexie 2011-09-04 22:16:52
引用回帖:
4楼: Originally posted by 临风7071 at 2011-09-04 19:54:47:
怎么用啊?今天看了一下,不会用,找不到输入序列的地方

http://swissmodel.expasy.org/wor ... RID&token=TOKEN
貌似是这个,记不清了,可以试试看
5楼2011-09-04 20:19:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hf2016

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
dhd997(金币+3): good 2011-09-05 18:44:01
同源建模法( Homology/Comparative modelling )
基于序列同源比对,对于序列相似度>30%的序列模拟比较有效,最常用的方法

http://swissmodel.expasy.org/
一切开始于结束之后
6楼2011-09-05 12:40:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hf2016

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
dhd997(金币+3): good 2011-09-05 18:44:08
要选择左侧的Modelling 里面的模式Automated Mode、 Alignment Mode
或者Project Mode进去然后就会出现email 和序列的输入框,
一切开始于结束之后
7楼2011-09-05 12:46:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ganchao1776

至尊木虫 (职业作家)

8楼2011-09-05 14:58:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

【答案】应助回帖

★ ★ ★
dhd997(金币+3): 很给力啊 2011-09-05 18:44:36
临风7071(金币+1): 谢谢 2011-09-05 23:06:29
临风7071(金币+1): 2011-09-06 13:58:13
http://linux1.softberry.com/berry.phtml
老板在康奈尔大学的时候就用这个!
真相是最大的奢侈品
9楼2011-09-05 15:22:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wlwabcd

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by wanhscn at 2011-09-05 15:22:29:
http://linux1.softberry.com/berry.phtml
老板在康奈尔大学的时候就用这个!

请问怎么用softberry来预测蛋白质三维结构啊,序列是怎么输进去的?那个ent格式的文件是怎么回事?谢谢!
10楼2012-01-10 22:29:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 临风7071 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 10/500 2026-11-09 03:58 by l48hFd8Nwae2
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-09 00:14 by l48hFd8Nwae2
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +8 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 23/1150 2026-11-07 06:49 by Equinoxhua
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 7/350 2026-11-06 16:43 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 5/250 2026-11-06 16:43 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 11/550 2026-11-06 16:32 by 5sJFDKp2kwuI
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 11/550 2026-11-06 16:10 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 15/750 2026-11-06 13:49 by BkA9Bi5cMhkD
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +7 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 17/850 2026-11-06 13:47 by BkA9Bi5cMhkD
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +7 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 14/700 2026-11-06 13:47 by BkA9Bi5cMhkD
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +6 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 11/550 2026-11-06 13:47 by BkA9Bi5cMhkD
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +8 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 14/700 2026-11-06 13:36 by BkA9Bi5cMhkD
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 10/500 2026-11-06 12:32 by BkA9Bi5cMhkD
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 5/250 2026-11-06 09:01 by 2lRNluKrJpwL
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 10/500 2026-11-06 05:32 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 8/400 2026-11-06 02:24 by qL1cU46YIdK0
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 9/450 2026-11-06 02:15 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 02:04 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 hNpp4Y2CGvSC 2026-11-04 12/600 2026-11-06 01:53 by qL1cU46YIdK0
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-05 11:10 by PYZmcHr5kSaq
信息提示
请填处理意见