24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1711  |  回复: 8

gjh123

金虫 (正式写手)

[求助] vasp 并行运算出错

经过一个星期的摸索,终于在电脑上并行安装成功了vasp .但是令入恼火的是每一次运行都出现错误:mpirun noticed that process rank 0 with PID 3882 on node localhost.localdomain exited on signal 11 (Segmentation fault).  不知道是什么原因。急盼高手能够解答一下。谢谢
        我的电脑配置是单机双核cpu,内存2G。我算的任务原子数大约有80个左右。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gjh123

金虫 (正式写手)

又碰到一个问题:vasp 并行运算效率很低,CPU使用率只有百分之十几,内存也只占几兆。
每次运行都出现下面的提示:
[[57390,1],0]: A high-performance Open MPI point-to-point messaging module
was unable to find any relevant network interfaces:

Module: OpenFabrics (openib)
  Host: cluster.hpc.org

Another transport will be used instead, although this may result in
lower performance.
--------------------------------------------------------------------------
[cluster.hpc.org:18613] 3 more processes have sent help message help-mpi-btl-base.txt / btl:no-nics
[cluster.hpc.org:18613] Set MCA parameter "orte_base_help_aggregate" to 0 to see all help / error messages



不知道哪个高手懂得,帮忙指点一下。
2楼2011-09-02 15:52:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liliangfang

荣誉版主 (著名写手)

【答案】应助回帖


gjh123(金币+5): 2011-09-02 21:26:06
zzy870720z(金币+1): 谢谢建议 2011-09-03 17:14:13
以你目前的机器,80个粒子是算不动的,你换个小点的试试,先算几个粒子的
3楼2011-09-02 15:55:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liliangfang

荣誉版主 (著名写手)

【答案】应助回帖


gjh123(金币+5): 2011-09-02 21:26:12
zzy870720z(金币+1): 谢谢补充 2011-09-03 17:14:23
gjh123(金币+5): 2011-09-06 08:37:13
还有你确定vasp安装成功不,有没有测试过
4楼2011-09-02 15:57:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gjh123

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by liliangfang at 2011-09-02 15:57:22:
还有你确定vasp安装成功不,有没有测试过

测试过,vasp 能够运行。我用串行编译的vasp 的CPU使用率也不高,和并行的差不多。
5楼2011-09-02 21:25:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liliangfang

荣誉版主 (著名写手)

【答案】应助回帖


zzy870720z(金币+1): 谢谢指教 2011-09-03 17:14:34
引用回帖:
5楼: Originally posted by gjh123 at 2011-09-02 21:25:56:
测试过,vasp 能够运行。我用串行编译的vasp 的CPU使用率也不高,和并行的差不多。

你窜行版本,是不是用了并行的命令啦,mpirun并行的啊
6楼2011-09-03 09:37:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gjh123

金虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by liliangfang at 2011-09-03 09:37:05:
你窜行版本,是不是用了并行的命令啦,mpirun并行的啊

串行版本没有用mpirun命令
7楼2011-09-03 19:56:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

后天一

木虫 (小有名气)

我们的自由!

【答案】应助回帖


gjh123(金币+5): 2011-09-04 08:28:24
zzy870720z(金币+1): 谢谢建议 2011-09-04 09:53:40
这个和编译器还是有关系的,试试PGI编译
8楼2011-09-03 22:33:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liliangfang

荣誉版主 (著名写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by gjh123 at 2011-09-03 19:56:32:
串行版本没有用mpirun命令

不等于没说嘛
9楼2011-09-04 08:24:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 gjh123 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 电子信息279求调剂,有书读就行 +4 wwwooden 2026-04-08 6/300 2026-04-10 11:24 by 木子君1218
[考研] 调剂 +10 卷卷卷心菜_ 2026-04-09 10/500 2026-04-10 09:53 by Delta2012
[考研] 070300化学学硕311分求调剂 +12 梁富贵险中求 2026-04-04 14/700 2026-04-10 08:07 by kangsm
[考研] 332,085601求调剂 +12 ydfyh 2026-04-09 14/700 2026-04-09 17:28 by wp06
[考研] 291求调剂 +7 关忆北. 2026-04-09 8/400 2026-04-09 15:17 by 探123
[考研] 22408 270分 +9 sanjin020722 2026-04-08 10/500 2026-04-09 14:11 by 诗与自由
[考研] 一志愿上海大学生物学346 +4 上海大学346调剂 2026-04-03 4/200 2026-04-09 10:52 by yiminglu
[考研] 求助071001调剂!!! +7 黄守松 2026-04-05 8/400 2026-04-09 09:07 by 徐良白眉大侠
[考研] 一志愿华东理工085601材料工程303分求调剂 +15 a1708 2026-04-06 15/750 2026-04-08 16:23 by luoyongfeng
[考研] 一志愿哈工大,初试329,求环境科学与工程调剂! +11 余未辛 2026-04-06 11/550 2026-04-08 15:21 by screening
[考研] 生物医药调剂|SCI中科院三区一作+多项科研成果 +8 likangxing 2026-04-07 11/550 2026-04-08 00:02 by lys0704
[考研] 301求调剂 +18 121. 2026-04-04 18/900 2026-04-07 17:49 by 蓝云思雨
[考研] 0854求调剂 +9 亨氏番茄沙司 2026-04-06 10/500 2026-04-07 14:37 by shdgaomin
[考研] 286求调剂 +20 Faune 2026-04-06 20/1000 2026-04-07 11:33 by 诗与自由
[考研] 求调剂到材料 +5 程9915 2026-04-06 5/250 2026-04-06 15:21 by yulian1987
[考研] 085600,320分求调剂 +16 大馋小子 2026-04-04 17/850 2026-04-06 07:58 by MOF_Catal
[考研] 283求调剂 +5 baiiyu 2026-04-05 6/300 2026-04-05 20:35 by 啵啵啵0119
[考研] 求调剂 +10 Hll胡 2026-04-04 10/500 2026-04-05 20:09 by nepu_uu
[考研] 求调剂 +4 压力??大 2026-04-03 4/200 2026-04-03 21:36 by 啵啵啵0119
[考研] 295求调剂 +3 尚偌呀 2026-04-03 4/200 2026-04-03 21:23 by zhq0425
信息提示
请填处理意见