[求助] 关于筛选和鉴定细菌(16S rRNA)

2楼: Originally posted by 粉靛蓝 at 2011-08-29 15:50:53:
测序是自己测吗，你测完了 一样要分析，既然你目的是筛菌 那你就先筛选出你想要的菌 在选几个好的鉴定吧

6楼: Originally posted by aegeansea at 2011-08-30 11:26:58:
方法是可行的。
但前期工作量小的后果就是后期测序结果拿到后的分析工作量增大
而且还要考虑测序错误等问题
需要找一个懂生物信息的团队或人来做这个工作
否则很难达到lz的要求吧

7楼: Originally posted by quiller2000 at 2011-08-30 23:27:17:
如果你的课题组足够有钱，直接把你的样品拿去做deep sequencing吧

但是坦率的说，我不理解楼主的设计！

9楼: Originally posted by 西门炊饼 at 2011-08-31 08:53:32:
当然只能这么整，我的目的就是把样品里的菌（比如说共50种菌）能够比较完整的分离出来（分离出来30种或40种），追求的是性价比

12楼: Originally posted by yemuren at 2011-08-31 10:38:35:
首先，我同意楼主先用16s来鉴定，一般情况下16s能鉴定到属，得到想要的后再用生理生化鉴定，工作量会小很多。但是，LZ的分子鉴定方法有待商榷，菌落不纯，或者不是单克隆，那么测序结果就会出现双峰或杂峰，这样的 ...

11楼: Originally posted by aegeansea at 2011-08-31 10:34:36:
测序只能鉴定 不能分离
要分离的话 还是要克隆的 这个工作没法省

16楼: Originally posted by abduwaly at 2011-09-02 01:47:15:
你好，微生物分离鉴定可分为可培养微生物鉴定和不可培养微生物鉴定。可培养法是需要必须经过细心培养和纯化。而不可培养法不需要分离，只是把总DNA提取进行PAGE电泳即可得到样品中的细菌类型。但不能获得菌落的信 ...

20楼: Originally posted by nancyyazi at 2011-09-08 09:04:04:
我觉得你既然是分离细菌（我不清楚你要分离的是什么细菌），至少要经过初筛和复筛吧。筛选出来比较好的也就那么几株，你再进行生理生化鉴定和16s RNA，这样工作量就会小很多。