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lyqifeih

新虫 (小有名气)

[求助] PCR最短可以P多少bp,求大家帮我设计引物!

我是新手做PCR,以前是做电生理的,郁闷。现在要做PCR,PCR最短可以P多少bp啊,我需要P的越短越好!可以P 60bp、100bp么?求大家帮助。求大家帮我设计下面序列的引物,我主要的目的片段是红色部分。TTCAACTGTTGTTGCCTATTAAGAAACCTAATAAAGCTCCACCTTCTTTATCTCTGAAAGTGAACTCCCTGCTACCTTTGTGGACTGACAGCTTTTTATAGTCACGTGACACAGTCAAACATTAACTTGGTGTATCGATTGGTTTTTGCCATATATATATATATAAGTAGGAGAGGGCGAACCTCTGGCAGGAGCAAAGGCGCCATGGCTGTGGAGTCCCAGGGCGGACGCCCACTTGTCCTGGGCCTGCTGCTGTGTGTGCTGGGCCCAGTGGTGTCCCATGCTGGGAAGATACTGTTGATCCCAGTGGATGGCAGCCACTGGCTGAGCATGCTTGGGGCCATCCAGCAGCTGCAGCAGAGGGGACATGAAATAGTTGTCCTAGCACCTGACGCCTCGTTGTACATCAGAGACGGAGCATTTTACACCTTGAAGACGTACCCTGTGCCATTCCAAAGGGAGGATGTGAAAGAGTC
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空谷幽风

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
西瓜(金币+3, MolEPI+1): Good 2011-08-26 17:49:43
lyqifeih(金币+5): 2011-08-26 19:36:40
lyqifeih(金币+5): 2011-09-01 13:18:54
如果你只是证明一下这段序列是否存在的话可以扩完PCR产物后直接取测序验证,由于目前测序技术的限制,从测序引物3‘端最后一个引物开始测的前60bp一般是不可信的(有些测序公司做的不错,20bp以后就可信了,不过为了保证可信度请按60bp来算),所以你扩增的最短的PCR产物应该为:2条引物的长度+60*2+目的条带长度约为200bp!
a?,c??ae~?a,EURc§?c?μé-,cs,,a‘?é?“i1/4?i1/4?i1/4?i1/4?
6楼2011-08-26 17:32:54
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