应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 用DMol3计算离子型化合物电荷的布局分布
101/1返回列表
查看: 6430  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

jolly1987

金虫 (小有名气)

[求助] 用DMol3计算离子型化合物电荷的布局分布

请教用DMol3计算离子型化合物电荷的布局分布时，该如何设置？例如：

构建的分子

设置



电荷计算是用Mullike还是Hirshfield analysis，还是ESP charge？
小妹初涉MS，还请大侠们指点，谢谢！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-08-22 20:09:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

剑魄诗魂

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
youzhizhe(金币+2): 谢谢交流。 2011-08-23 14:48:50
jolly1987(金币+3): 谢谢！ 2011-08-23 15:21:41
你的设置没什么问题啊，population analysis那里选择atomic charge就可以了，那样的话，算完以后，使用DMol3的Analysis，点击assign把Mulliken原子电荷加到优化以后的结构上去，然后右键Label，添加charge，就可以看到直观的电荷布局分布了，你的结构这么简单，几个小时就能搞定了
赞一下(3人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

江蓠
且邀浊圣嗤名禄，因忆莼鲈弃旧游。常效楚狂能恣肆，敢称才士故风流。
2楼2011-08-22 21:29:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jolly1987

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 剑魄诗魂 at 2011-08-22 21:29:48:
你的设置没什么问题啊，population analysis那里选择atomic charge就可以了，那样的话，算完以后，使用DMol3的Analysis，点击assign把Mulliken原子电荷加到优化以后的结构上去，然后右键Label，添加charge，就可以 ...

谢谢哈，那电荷计算是用Mullike还是Hirshfield analysis，还是ESP charge？这个带1个正电荷的离子型化合物总charge是设为1吧，如果是羧酸完全电离，是设为-1吧？因为和文献报导出入很大，所以比较担心，第一次用这个模块~
赞一下 回复此楼
3楼2011-08-23 08:32:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

剑魄诗魂

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
youzhizhe(金币+1): 谢谢交流。 2011-08-23 14:48:58
引用回帖:
3楼: Originally posted by jolly1987 at 2011-08-23 08:32:50:
谢谢哈，那电荷计算是用Mullike还是Hirshfield analysis，还是ESP charge？这个带1个正电荷的离子型化合物总charge是设为1吧，如果是羧酸完全电离，是设为-1吧？因为和文献报导出入很大，所以比较担心，第一次用 ...

我不写了Mulliken了吗，你截的界面就可以直接算了，charge为1没问题
赞一下(1人) 回复此楼
且邀浊圣嗤名禄，因忆莼鲈弃旧游。常效楚狂能恣肆，敢称才士故风流。
4楼2011-08-23 09:10:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jolly1987

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 剑魄诗魂 at 2011-08-23 09:10:26:
我不写了Mulliken了吗，你截的界面就可以直接算了，charge为1没问题

不好意思，大侠，能再弱弱的问一句，为什么是Mulliken吗？看有人说，Mulliken 基于电子轨道，是以波函数来分析的；Hirshfeld是基于电荷密度来分析的；ESP charge，就是指用静电势拟合的电荷，该方法得到的电荷比mulliken电荷要合理。那不是该用ESP吗？这3个结果差别挺大的，还是不清楚向我这种有机小分子应该用哪个的结果，谢谢~~~
赞一下 回复此楼
5楼2011-08-23 09:56:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

剑魄诗魂

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by jolly1987 at 2011-08-23 09:56:04:
不好意思，大侠，能再弱弱的问一句，为什么是Mulliken吗？看有人说，Mulliken 基于电子轨道，是以波函数来分析的；Hirshfeld是基于电荷密度来分析的；ESP charge，就是指用静电势拟合的电荷，该方法得到的电荷比 ...

我也不好意思啊，我就是照着自己看过的文献所以去分析Mulliken电荷的，至于为什么还真没考虑过，恐怕没法给你解释。。。
赞一下 回复此楼
且邀浊圣嗤名禄，因忆莼鲈弃旧游。常效楚狂能恣肆，敢称才士故风流。
6楼2011-08-23 19:33:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

t13340033021

金虫 (正式写手)
讨论化学反应位点最好还是ESP
赞一下 回复此楼
甲烷无敌
7楼2013-06-22 09:07:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

江蓠

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 剑魄诗魂 at 2011-08-22 21:29:48
你的设置没什么问题啊，population analysis那里选择atomic charge就可以了，那样的话，算完以后，使用DMol3的Analysis，点击assign把Mulliken原子电荷加到优化以后的结构上去，然后右键Label，添加charge，就可以看 ...

我算出来氮掺杂碳材料的每个原子电荷都是0，不知道哪弄错了，求高人指点啊

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
8楼2018-06-21 22:07:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

江蓠

新虫 (小有名气)
我按照楼主的设置来的，但是算出来每个原子电荷为零啊，不知道哪错了

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
9楼2018-06-21 22:09:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

桑榆文

捐助贵宾 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by jolly1987 at 2011-08-23 09:56:04
不好意思，大侠，能再弱弱的问一句，为什么是Mulliken吗？看有人说，Mulliken 基于电子轨道，是以波函数来分析的；Hirshfeld是基于电荷密度来分析的；ESP charge，就是指用静电势拟合的电荷，该方法得到的电荷比mu ...

我设置的是1，但是total charge为1.02，这怎么修改？
赞一下 回复此楼
10楼2018-09-12 10:13:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 jolly1987 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的？ +12 爱看书的可乐 2026-08-26 14/700 2026-08-26 13:50 by coolysnow
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +26 yaoyewhu2008 2026-08-20 28/1400 2026-08-26 13:49 by zzuzxg
[基金申请] 科研孤儿太难了 +21 我4大白菜 2026-08-20 22/1100 2026-08-26 11:29 by nlgza
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +22 koalala 2026-08-24 25/1250 2026-08-26 11:14 by dxcharlary
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +6 process2012 2026-08-23 8/400 2026-08-26 11:03 by zjlp
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[职场人生] 学生撞见辅导员送外卖，第二天全班都沉默了 +3 鲸鱼融金_浙江_� 2026-08-22 3/150 2026-08-26 09:01 by zzuzxg
[基金申请] 国合现在查不到了吗？ +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 牛来！米来！面来！ +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件，有关系吗？ +24 木水思豆 2026-08-25 27/1350 2026-08-26 08:26 by yanchen918
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +21 羊腰板 2026-08-21 24/1200 2026-08-26 07:20 by finnigan
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候，我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 22/1100 2026-08-25 15:36 by 医学老男孩
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[教师之家] 导师吐槽：我怎么摊上了这么个极品研究生！ +3 苏东坡二世 2026-08-23 3/150 2026-08-25 10:35 by shisan1313
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[基金申请] 时间戳今天，20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 看来今天不会放榜了？ +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭