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jolly1987

金虫 (小有名气)

[求助] 用DMol3计算离子型化合物电荷的布局分布

请教用DMol3计算离子型化合物电荷的布局分布时,该如何设置?例如:

构建的分子

设置



电荷计算是用Mullike还是Hirshfield analysis,还是ESP charge?
小妹初涉MS,还请大侠们指点,谢谢!
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jolly1987

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 剑魄诗魂 at 2011-08-22 21:29:48:
你的设置没什么问题啊,population analysis那里选择atomic charge就可以了,那样的话,算完以后,使用DMol3的Analysis,点击assign把Mulliken原子电荷加到优化以后的结构上去,然后右键Label,添加charge,就可以 ...

谢谢哈,那电荷计算是用Mullike还是Hirshfield analysis,还是ESP charge?这个带1个正电荷的离子型化合物总charge是设为1吧,如果是羧酸完全电离,是设为-1吧?因为和文献报导出入很大,所以比较担心,第一次用这个模块~
3楼2011-08-23 08:32:50
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剑魄诗魂

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
youzhizhe(金币+2): 谢谢交流。 2011-08-23 14:48:50
jolly1987(金币+3): 谢谢! 2011-08-23 15:21:41
你的设置没什么问题啊,population analysis那里选择atomic charge就可以了,那样的话,算完以后,使用DMol3的Analysis,点击assign把Mulliken原子电荷加到优化以后的结构上去,然后右键Label,添加charge,就可以看到直观的电荷布局分布了,你的结构这么简单,几个小时就能搞定了

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且邀浊圣嗤名禄,因忆莼鲈弃旧游。常效楚狂能恣肆,敢称才士故风流。
2楼2011-08-22 21:29:48
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剑魄诗魂

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


youzhizhe(金币+1): 谢谢交流。 2011-08-23 14:48:58
引用回帖:
3楼: Originally posted by jolly1987 at 2011-08-23 08:32:50:
谢谢哈,那电荷计算是用Mullike还是Hirshfield analysis,还是ESP charge?这个带1个正电荷的离子型化合物总charge是设为1吧,如果是羧酸完全电离,是设为-1吧?因为和文献报导出入很大,所以比较担心,第一次用 ...

我不写了Mulliken了吗,你截的界面就可以直接算了,charge为1没问题
且邀浊圣嗤名禄,因忆莼鲈弃旧游。常效楚狂能恣肆,敢称才士故风流。
4楼2011-08-23 09:10:26
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jolly1987

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 剑魄诗魂 at 2011-08-23 09:10:26:
我不写了Mulliken了吗,你截的界面就可以直接算了,charge为1没问题

不好意思,大侠,能再弱弱的问一句,为什么是Mulliken吗?看有人说,Mulliken 基于电子轨道,是以波函数来分析的;Hirshfeld是基于电荷密度来分析的;ESP charge,就是指用静电势拟合的电荷,该方法得到的电荷比mulliken电荷要合理。那不是该用ESP吗?这3个结果差别挺大的,还是不清楚向我这种有机小分子应该用哪个的结果,谢谢~~~
5楼2011-08-23 09:56:04
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