| 查看: 2246 | 回复: 13 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
B类错误420及游离水加氢问题
|
|||
|
问题； 1、我如何用.lst中的信息重新换坐标精修呢？ Alternative approximate positions for H attached to O1: 0.5175 0.1270 0.3770 O..O3 [ -x+1, -y, -z+1 ] 2.706 2、420的B类错误如何解决呢？我搞了快两天了，很纠结。我用的是wingx-maps-calcu-OH计算加游离水的氢的，最好的结果，就是检查后，只有4个420B类错误。请高手指点。投非晶体学报是否可以不管了呢？谢谢。 ３、精修加氢是以.lst中的为第一解决，还是用wingx的计算为第一呢？即，哪个优先呢？谢谢。 4、如果实在加不了，如果上面两种办法都不行，也可以不加氢，在文章中给以适当的说明即可；此外，用Platon中的Squeeze功能去掉溶剂水对整个结构精修的贡献。最后再根据计算结果把所缺少的电子个数加入到cif文件中(Fooo)，相应把分子式、分子量都要做相应的改变, 文章中精修部分也要给以适当的说明。 这个具体如何做呢？谢谢。 请具体指点，不要说什么发您邮箱里看看的话，我是来学习的。 授人与鱼，不若授人与渔。 这是精修后.lst文件中的信息 Specified hydrogen bonds (with esds except fixed and riding H) D-H H...A D...A <(DHA) 0.85 2.37 2.706(6) 104.3 O1-H1B...O3_$1 0.85 2.23 2.739(6) 118.4 O1-H1A...O4 0.85 2.26 2.914(8) 134.1 O2-H2B...N4 ** No suitable H-bond found for O2...N5_$2 = 2.981(8) A ** 0.85 2.14 2.873(7) 144.0 O3-H3B...O4 0.85 2.12 2.754(8) 130.9 O4-H4B...O5 0.85 2.24 2.758(7) 119.0 O4-H4A...O2 ** No suitable H-bond found for O5...O4 = 2.754(8) A ** 0.85 2.73 2.953(8) 96.8 O5-H5A...N4_$3 Hydrogen bonds with H..A < r(A) + 2.000 Angstroms and D-H d(D-H) d(H..A) O1-H1A 0.850 2.231 118.39 2.739 O4 O1-H1B 0.850 ------------------------------------------------------------------------------ Alternative approximate positions for H attached to O1: 0.5175 0.1270 0.3770 O..O3 [ -x+1, -y, -z+1 ] 2.706 O2-H2A 0.850 ------------------------------------------------------------------------------ Alternative approximate positions for H attached to O2: 0.3266 0.1252 0.3759 O..O4 2.758 O2-H2B 0.850 2.258 134.07 2.914 N4 O3-H3A 0.850 ------------------------------------------------------------------------------ Alternative approximate positions for H attached to O3: 0.4479 -0.0741 0.5823 O..O1 [ -x+1, -y, -z+1 ] 2.706 O3-H3B 0.850 2.141 144.00 2.873 O4 O4-H4A 0.850 2.244 118.95 2.758 O2 O4-H4B 0.850 2.121 130.88 2.754 O5 O5-H5A 0.850 ------------------------------------------------------------------------------ Alternative approximate positions for H attached to O5: 0.3537 -0.0560 0.2584 O..O4 2.754 O5-H5B 0.850 2.351 130.02 2.970 N5   [ Last edited by wzgynkmlhf on 2011-8-22 at 08:48 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
中南大学易小艺课题组诚招2026申请-考核制博士生
已经有0人回复
-
海南师范大学招收化学博士（光电功能材料课题组招收博士研究生）
已经有10人回复
-
无机化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有221人回复
-
求助几个团簇的cif
已经有0人回复
-
急求该反应的详细机理
已经有5人回复
-
【Ei | Scopus 双检索】2026年智能交通与未来出行国际会议（CSTFM 2026）
已经有0人回复
-
【EI|Scopus 双检索】2026年第六届机器人与人工智能国际会议（JCRAI 2026）
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 关于基因构建中开放阅读框架的若干问题
已经有7人回复
- 枯草芽孢杆菌表达的问题
已经有8人回复
- 100金币请高手把H加上，不是游离水的，是普通的H，理论加氢就OK
已经有7人回复
- 求解DNA浓度测量中的一些问题
已经有3人回复
- 求大侠帮忙解决一个B类错误！！谢谢
已经有5人回复
- 配位水游离水加氢问题 精修问题
已经有13人回复
- 石墨烯纳米带 vasp建模 边缘如何加氢
已经有28人回复
- 游离水加氢问题
已经有5人回复
- 重金求助解决checkcif错误，主要是晶格水的加氢
已经有10人回复
- 几个A类错误及游离水加氢问题处理
已经有5人回复
- 【求助】游离水分子理论加氢的命令
已经有4人回复
- 【讨论】晶体解析过程中有关游离水的理论加氢
已经有8人回复
- 【求助】游离水加不上氢要在文章的什么位置说明或者有什么加氢的方法介绍一下
已经有6人回复
- 【求助/交流】重叠PCR相关问题。
已经有8人回复
- 【求助】如何解决高压釜水相加氢反应中金属催化剂的流失问题
已经有41人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
香港岭南大学郭瑛课题组博士招生 (2026年秋季入学）
+1/186
-
诚招化工、有机、高分子等领域博士后及科研助理
+2/146
-
黄汉民团队联合淮北师范大学招聘师资博士后（年薪30-40万）
+1/88
-
诚聘 有机光电材料计算方向 博士后、科研助理、访问学生
+1/75
-
电力全国重点实验室双一流A类长江学者团队招2026年全日制博士1-2名/博士后
+2/68
-
意大利华人老师University of Padova-全额奖学金博士
+1/30
-
中科院深圳先进院-免疫治疗方向-招收1名博士生(26年9月入学)
+1/26
-
德国Karlsruhe Institute of Technology招收电化学储能及联合培养CSC博士等
+1/17
-
西班牙巴塞罗那访学、博后、留学互动
+1/11
-
四川大学华西医院沈百荣教授课题组科研助理招聘启事
+1/9
-
中山大学柔性电子学院黄维院士团队诚招柔性可穿戴电子方向博士生（2026年9月入学）
+1/7
-
招聘农用化学产品销售一名，须具备良好的英语口语，以便拓展海外市场。
+1/7
-
广东省智能院与澳门大学/澳门理工联培博士招生
+1/5
-
复旦大学化学系凡勇教授/张凡教授团队招聘博士后
+1/4
-
【博士后/科研助理招聘-北京理工大学-集成电路与电子学院-国家杰青团队】
+1/4
-
海南大学化学院—功能分子器件团队2026博士/研究助理招生+博士后招聘
+1/4
-
武汉工程大学董志兵教授课题组招收博士/硕士研究生（长期有效）
+1/2
-
【博士后/科研助理招聘-北京理工大学-集成电路与电子学院-国家杰青团队】
+1/2
-
苏州大学医学院纳米生物医学方向招收申请考核制博士生1名
+1/1
-
澳科大诚招2026年秋季全奖博士研究生（药剂学/生物材料方向）
+1/1
9楼2011-08-22 14:08:12
3楼2011-08-22 09:02:40
5楼2011-08-22 09:41:08
6楼2011-08-22 09:59:34