24小时热门版块排行榜    

查看: 897  |  回复: 2

qingtingzhe

银虫 (正式写手)

步行者

[求助] 求助用DS进行同源建模的高手

求助用DS进行同源建模的高手:
1  我在进行同源建模时,在将目标序列和模板比对时,教程让用uniref90比对,但DS 中不带这个数据库,不知哪位高手知道怎么添加这个数据库?
2 我在序列比对结束后,用modeler构建3D模型时,出现如下问题,请帮解答一下:

Error Messages
  Model scaf_rename_new.faGL004399.B99990001.pdb not found. Please check MODELER log file (modeler.log).
Model scaf_rename_new.faGL004399.B99990002.pdb not found. Please check MODELER log file (modeler.log).
Model scaf_rename_new.faGL004399.B99990003.pdb not found. Please check MODELER log file (modeler.log).
Model scaf_rename_new.faGL004399.B99990004.pdb not found. Please check MODELER log file (modeler.log).
Model scaf_rename_new.faGL004399.B99990005.pdb not found. Please check MODELER log file (modeler.log).
Engine failed to generate any model. Please check MODELER log file (modeler.log).
0 28 Traceback (most recent call last): File "modeler.py", line 44, in ? m.make() File "C:\Program Files\Accelrys\PipelinePilot\apps\scitegic\dscore\server\share\modeler\modlib\modeller\automodel\automodel.py", line 99, in make self.homcsr(exit_stage) File "C:\Program Files\Accelrys\PipelinePilot\apps\scitegic\dscore\server\share\modeler\modlib\modeller\automodel\automodel.py", line 426, in homcsr self.check_alignment(aln) File "C:\Program Files\Accelrys\PipelinePilot\apps\scitegic\dscore\server\share\modeler\modlib\modeller\automodel\automodel.py", line 408, in check_alignment aln.check() File "C:\Program Files\Accelrys\PipelinePilot\apps\scitegic\dscore\server\share\modeler\modlib\modeller\alignment.py", line 191, in check self.check_structure_structure(io=io) File "C:\Program Files\Accelrys\PipelinePilot\apps\scitegic\dscore\server\share\modeler\modlib\modeller\alignment.py", line 200, in check_structure_structure return f(self.modpt, io.modpt, self.env.libs.modpt, eqvdst) _modeller.ModellerError: check_a_282E> Unable to read structural information for alignment sequence: 5 2B1XA This command requires structures.

[ Last edited by ghcacj on 2011-8-17 at 09:34 ]
回复此楼
人的上半生不要犹豫,下半生不要后悔
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

blue_cat

木虫 (正式写手)

那个数据库在购买正版的DS时是随盘赠送的,不知道网上有没有资源可以下载
DS
2楼2011-08-18 12:46:18
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qingtingzhe

银虫 (正式写手)

步行者

引用回帖:
2楼: Originally posted by blue_cat at 2011-08-18 12:46:18:
那个数据库在购买正版的DS时是随盘赠送的,不知道网上有没有资源可以下载

请问:你有那个数据库吗?能发给我吗
人的上半生不要犹豫,下半生不要后悔
3楼2011-08-18 21:05:52
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 qingtingzhe 的主题更新
信息提示
请填处理意见