| 查看: 1028 | 回复: 2 | ||
qingtingzhe银虫 (正式写手)
步行者
|
[求助]
求助用DS进行同源建模的高手
|
|
求助用DS进行同源建模的高手： 1 我在进行同源建模时，在将目标序列和模板比对时，教程让用uniref90比对，但DS 中不带这个数据库，不知哪位高手知道怎么添加这个数据库？ 2 我在序列比对结束后，用modeler构建3D模型时，出现如下问题，请帮解答一下： Error Messages Model scaf_rename_new.faGL004399.B99990001.pdb not found. Please check MODELER log file (modeler.log). Model scaf_rename_new.faGL004399.B99990002.pdb not found. Please check MODELER log file (modeler.log). Model scaf_rename_new.faGL004399.B99990003.pdb not found. Please check MODELER log file (modeler.log). Model scaf_rename_new.faGL004399.B99990004.pdb not found. Please check MODELER log file (modeler.log). Model scaf_rename_new.faGL004399.B99990005.pdb not found. Please check MODELER log file (modeler.log). Engine failed to generate any model. Please check MODELER log file (modeler.log). 0 28 Traceback (most recent call last): File "modeler.py", line 44, in ? m.make() File "C:\Program Files\Accelrys\PipelinePilot\apps\scitegic\dscore\server\share\modeler\modlib\modeller\automodel\automodel.py", line 99, in make self.homcsr(exit_stage) File "C:\Program Files\Accelrys\PipelinePilot\apps\scitegic\dscore\server\share\modeler\modlib\modeller\automodel\automodel.py", line 426, in homcsr self.check_alignment(aln) File "C:\Program Files\Accelrys\PipelinePilot\apps\scitegic\dscore\server\share\modeler\modlib\modeller\automodel\automodel.py", line 408, in check_alignment aln.check() File "C:\Program Files\Accelrys\PipelinePilot\apps\scitegic\dscore\server\share\modeler\modlib\modeller\alignment.py", line 191, in check self.check_structure_structure(io=io) File "C:\Program Files\Accelrys\PipelinePilot\apps\scitegic\dscore\server\share\modeler\modlib\modeller\alignment.py", line 200, in check_structure_structure return f(self.modpt, io.modpt, self.env.libs.modpt, eqvdst) _modeller.ModellerError: check_a_282E> Unable to read structural information for alignment sequence: 5 2B1XA This command requires structures. [ Last edited by ghcacj on 2011-8-17 at 09:34 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有3人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急
已经有3人回复
-
售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有3人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有3人回复
-
售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 同源建模，希望建的蛋白质结构，N端和C端分别使用不同的蛋白模版，请教
已经有11人回复
- 求助：本人新手，想分段同源建模，不知道用什么软件和方法？
已经有11人回复
- 【求助】在swiss model 同源建模以后得到的结果怎么分析
已经有8人回复
- 【求助】从同源建模开始，一个完整的分子对接实验需要多久？
已经有7人回复
- 【讨论】分子模拟还是同源建模
已经有16人回复
- 【求助】modeller同源建模结果选择
已经有10人回复
- 【求助】同源建模、分子动力学模拟和分子对接的关系是怎样的
已经有9人回复
- 【求助/交流】求高手指点，。。同源基因
已经有6人回复
- 【求助】蛋白质建模没有同源模板怎么解决？
已经有11人回复
blue_cat
木虫 (正式写手)
- 模拟EPI: 1
- 应助: 50 (小学生)
- 金币: 5248.1
- 红花: 11
- 帖子: 843
- 在线: 107.2小时
- 虫号: 983443
- 注册: 2010-03-27
- 性别: GG
- 专业: 药物化学
2楼2011-08-18 12:46:18
qingtingzhe
银虫 (正式写手)
步行者
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 1218.9
- 散金: 271
- 红花: 3
- 帖子: 410
- 在线: 75.1小时
- 虫号: 1188203
- 注册: 2011-01-12
- 性别: GG
- 专业: 病毒学
3楼2011-08-18 21:05:52
20