应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » slab表面小分子反应，如何验算过渡态的虚频？
61/1返回列表
查看: 1265  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

[求助] slab表面小分子反应，如何验算过渡态的虚频？

比如一个6层原子层的slab上表面吸附小分子。slab下部3层原子是固定的。验算虚频的时候，是不是还是固定下面三层原子，然后按照一般频率计算方法来算虚频？这样的话，可以移动的原子数在20～40左右，考虑三个自由度，及其组合，就有很多很多可能了。请问该怎么设置这样的过渡态虚频计算呢？

计算slab吸附小分子的振动时，我是固定除小分子外所有原子的，如果小分子是三原子的，就有3*3*3=27个离子步要跑了，时间上很长的。

求slab表面小分子反应的过渡态虚频计算的INCAR的和POSCAR设置方法。

[ Last edited by cenwanglai on 2011-8-16 at 00:50 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-08-16 00:49:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

贺仪

铁杆木虫 (著名写手)
帮顶！没算过虚频……
赞一下 回复此楼
嘟啦啦嘟啦啦嘟
2楼2011-08-16 08:30:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lgxyz

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

cenwanglai(金币+4): 谢谢回复！ 2011-08-16 16:13:13
引用回帖:
1楼: Originally posted by cenwanglai at 2011-08-16 00:49:22:
比如一个6层原子层的slab上表面吸附小分子。slab下部3层原子是固定的。验算虚频的时候，是不是还是固定下面三层原子，然后按照一般频率计算方法来算虚频？这样的话，可以移动的原子数在20～40左右，考虑三个自由度 ...

就是用IBRION=5算就行了，坐标部分跟优化时一样
赞一下 回复此楼
3楼2011-08-16 09:24:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主
引用回帖:
3楼: Originally posted by lgxyz at 2011-08-16 09:24:34:
就是用IBRION=5算就行了，坐标部分跟优化时一样

我先试试看。呵呵
回复此楼
4楼2011-08-16 16:21:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主
引用回帖:
3楼: Originally posted by lgxyz at 2011-08-16 09:24:34:
就是用IBRION=5算就行了，坐标部分跟优化时一样

确实是如你如说的。

我用一个CeO2晶胞(12个原子)做计算测试，固定所有Ce原子，EDIFF = 1E-5, POTIM = 0.01的时候，有24个频率项，全部都是实频，在3~17THz之间。
赞一下 回复此楼
5楼2011-08-21 17:22:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lgxyz

铜虫 (正式写手)
★ ★
youzhizhe(金币+2): 谢谢交流。 2011-08-23 14:48:38
引用回帖:
5楼: Originally posted by cenwanglai at 2011-08-21 17:22:24:
确实是如你如说的。

我用一个CeO2晶胞(12个原子)做计算测试，固定所有Ce原子，EDIFF = 1E-5, POTIM = 0.01的时候，有24个频率项，全部都是实频，在3~17THz之间。

有时在算过渡态的虚频也不只是一个，一个大的对应于反应坐标，有时也会有若干小虚频，应该是可以忽略的。本身来讲，vasp的频率分析并不是很准确，毕竟只算一个gamma点。
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2011-08-23 10:46:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 cenwanglai 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求材料调剂 +10 隔壁陈先生 2026-03-12 10/500 2026-03-19 09:15 by 无际的草原
[考研] 0703化学调剂 +8 妮妮ninicgb 2026-03-15 12/600 2026-03-19 05:55 by anny19840123
[考研] 0703化学 305求调剂 +4 FY_yy 2026-03-14 4/200 2026-03-19 05:54 by anny19840123
[考研] 085410人工智能专硕317求调剂（0854都可以） +3 xbxudjdn 2026-03-18 3/150 2026-03-18 22:14 by zhq0425
[考研] 一志愿中海洋材料工程专硕330分求调剂 +5 小材化本科 2026-03-18 5/250 2026-03-18 21:53 by 无懈可击111
[考研] 一志愿武理材料305分求调剂 +5 想上岸的鲤鱼 2026-03-18 6/300 2026-03-18 17:53 by 无际的草原
[考研] 085600材料与化工 +5 安全上岸！ 2026-03-16 5/250 2026-03-18 15:33 by cmz0325
[考研] 312求调剂 +8 陌宸希 2026-03-16 9/450 2026-03-18 12:39 by Linda Hu
[考研] 0854，计算机类招收调剂 +3 胡辣汤放糖 2026-03-15 6/300 2026-03-18 12:09 by 上岸上岸……..
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +6 困于星晨 2026-03-17 6/300 2026-03-18 10:21 by kkcoco25
[考研] 268求调剂 +6 简单点0 2026-03-17 6/300 2026-03-18 09:04 by 无际的草原
[考研] 290求调剂 +6 孔志浩 2026-03-12 11/550 2026-03-17 14:41 by 周舟舟77
[考研] 211本，11408一志愿中科院277分，曾在中科院自动化所实习 +6 Losir 2026-03-12 7/350 2026-03-17 12:09 by danranxie
[考研] 一志愿211 0703方向310分求调剂 +3 努力奋斗112 2026-03-15 3/150 2026-03-16 16:44 by houyaoxu
[考研] 中科大材料与化工319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:10 by ms629
[考研] 255求调剂 +3 李嘉慧， 2026-03-12 4/200 2026-03-14 16:58 by 有只狸奴
[考研] 297求调剂 +4 学海漂泊 2026-03-13 4/200 2026-03-14 11:51 by 热情沙漠
[考研] 266求调剂 +4 学员97LZgn 2026-03-13 4/200 2026-03-14 08:37 by zhukairuo
[考研] 304求调剂 +7 7712b 2026-03-13 7/350 2026-03-13 21:42 by peike
[考研] 求调剂 +5 一定有学上- 2026-03-12 5/250 2026-03-13 18:31 by ms629
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭