应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » slab表面小分子反应，如何验算过渡态的虚频？
61/1返回列表
查看: 1267  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主

[求助] slab表面小分子反应，如何验算过渡态的虚频？

比如一个6层原子层的slab上表面吸附小分子。slab下部3层原子是固定的。验算虚频的时候，是不是还是固定下面三层原子，然后按照一般频率计算方法来算虚频？这样的话，可以移动的原子数在20～40左右，考虑三个自由度，及其组合，就有很多很多可能了。请问该怎么设置这样的过渡态虚频计算呢？

计算slab吸附小分子的振动时，我是固定除小分子外所有原子的，如果小分子是三原子的，就有3*3*3=27个离子步要跑了，时间上很长的。

求slab表面小分子反应的过渡态虚频计算的INCAR的和POSCAR设置方法。

[ Last edited by cenwanglai on 2011-8-16 at 00:50 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-08-16 00:49:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

贺仪

铁杆木虫 (著名写手)
帮顶！没算过虚频……
赞一下 回复此楼
嘟啦啦嘟啦啦嘟
2楼2011-08-16 08:30:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lgxyz

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

cenwanglai(金币+4): 谢谢回复！ 2011-08-16 16:13:13
引用回帖:
1楼: Originally posted by cenwanglai at 2011-08-16 00:49:22:
比如一个6层原子层的slab上表面吸附小分子。slab下部3层原子是固定的。验算虚频的时候，是不是还是固定下面三层原子，然后按照一般频率计算方法来算虚频？这样的话，可以移动的原子数在20～40左右，考虑三个自由度 ...

就是用IBRION=5算就行了，坐标部分跟优化时一样
赞一下 回复此楼
3楼2011-08-16 09:24:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主
引用回帖:
3楼: Originally posted by lgxyz at 2011-08-16 09:24:34:
就是用IBRION=5算就行了，坐标部分跟优化时一样

我先试试看。呵呵
回复此楼
4楼2011-08-16 16:21:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

老和山猥琐派九段

优秀版主
引用回帖:
3楼: Originally posted by lgxyz at 2011-08-16 09:24:34:
就是用IBRION=5算就行了，坐标部分跟优化时一样

确实是如你如说的。

我用一个CeO2晶胞(12个原子)做计算测试，固定所有Ce原子，EDIFF = 1E-5, POTIM = 0.01的时候，有24个频率项，全部都是实频，在3~17THz之间。
赞一下 回复此楼
5楼2011-08-21 17:22:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lgxyz

铜虫 (正式写手)
★ ★
youzhizhe(金币+2): 谢谢交流。 2011-08-23 14:48:38
引用回帖:
5楼: Originally posted by cenwanglai at 2011-08-21 17:22:24:
确实是如你如说的。

我用一个CeO2晶胞(12个原子)做计算测试，固定所有Ce原子，EDIFF = 1E-5, POTIM = 0.01的时候，有24个频率项，全部都是实频，在3~17THz之间。

有时在算过渡态的虚频也不只是一个，一个大的对应于反应坐标，有时也会有若干小虚频，应该是可以忽略的。本身来讲，vasp的频率分析并不是很准确，毕竟只算一个gamma点。
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2011-08-23 10:46:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 cenwanglai 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿天津大学化学工艺专业（081702）315分求调剂 +11 yangfz 2026-03-17 11/550 2026-03-19 15:06 by houyaoxu
[考研] 324分 085600材料化工求调剂 +3 llllkkkhh 2026-03-18 3/150 2026-03-19 14:22 by houyaoxu
[考研] 287求调剂 +3 晨昏线与星海 2026-03-19 4/200 2026-03-19 12:32 by peike
[考研] 材料080500调剂求收留 +4 一颗meteor 2026-03-13 4/200 2026-03-19 10:32 by 30660438
[考研] 一志愿武理材料305分求调剂 +5 想上岸的鲤鱼 2026-03-18 6/300 2026-03-18 17:53 by 无际的草原
[考研] 08工科 320总分 求调剂 +5 梨花珞晚风 2026-03-17 5/250 2026-03-18 14:49 by haxia
[考博] 26博士申请 +3 1042136743 2026-03-17 3/150 2026-03-17 23:30 by 轻松不少随
[考研] 考研求调剂 +3 橘颂. 2026-03-17 4/200 2026-03-17 21:43 by 有只狸奴
[考研] 考研化学学硕调剂，一志愿985 +4 张vvvv 2026-03-15 6/300 2026-03-17 17:15 by ruiyingmiao
[考研] 275求调剂 +4 太阳花天天开心 2026-03-16 4/200 2026-03-17 10:53 by 功夫疯狂
[考研] 302求调剂 +4 小贾同学123 2026-03-15 8/400 2026-03-17 10:33 by 小贾同学123
[考研] 考研调剂 +3 淇ya_~ 2026-03-17 5/250 2026-03-17 09:25 by Winj1e
[考研] 药学383 求调剂 +3 药学chy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 20:51 by 元子^0^
[考研] 318求调剂 +3 Yanyali 2026-03-15 3/150 2026-03-16 16:41 by houyaoxu
[考研] 0703一志愿211 285分求调剂 +5 ly3471z 2026-03-13 5/250 2026-03-16 16:16 by 哦哦123
[考研] 复试调剂 +3 呼呼？~+123456 2026-03-14 3/150 2026-03-14 16:53 by WTUChen
[考研] 学硕285求调剂 +13 Wisjxn 2026-03-12 46/2300 2026-03-14 10:33 by JourneyLucky
[考研] 330求调剂 +3 ?酱给调剂跪了 2026-03-13 3/150 2026-03-14 10:13 by JourneyLucky
[考研] 266求调剂 +4 学员97LZgn 2026-03-13 4/200 2026-03-14 08:37 by zhukairuo
[硕博家园] 085600 260分求调剂 +3 天空还下雨么 2026-03-13 5/250 2026-03-13 18:46 by 天空还下雨么
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭