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韩俊

金虫 (正式写手)

[求助] SDS-PAGE电泳求助

跑了几次电泳 ,跑出来的胶,总是靠近上样一段没有条带,下面又有显示了,而且Mark也只有5条(应该有六条),最高分子量(97.4)的条带不见了。有人跟我说是灌注分离胶后,液封的时候,吧上层的分离胶稀释了,所以高分子量就没有分开,造成上层一块没有条带。

可是液封时候我已经非常小心了,希望各位帮帮忙,分析分析原因,小弟不甚感激。
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416114799

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
西瓜(金币+5, MolEPI+1): 学习了! 2011-08-13 15:46:36
韩俊(金币+4): 谢谢你的详细解答,受教了 2011-08-14 12:58:39
蛋白质电泳影响因素非常多,我也提供一个想法,前提是你的各种药品都没有问题,尤其是APS和TEMED,这两个是导致胶凝固快慢的决定因素。
因为看到你整块胶都明显有染色颜色了,我想,可能与你的胶不均匀有关系,也就是说你下面的凝固得很快,但是上面的没有凝,导致胶不均匀。由此形成的孔径大小就不均匀,所以有些条带没有分开。一般凝胶是20~30分钟比较理想,我之前也搞得很晕,超过40分钟往往胶就不均匀,跑出来的带歪歪扭扭,有时也出现没有条带,凝胶时间太长不仅会影响均匀性,甚至连网孔都无法形成,丙烯酰胺→聚丙烯酰胺是形成网孔的过程。
如果你怀疑是液封的影响,你不妨做个试验,即不液封,因为液封只是为了使分离胶与积层胶之间的界限凭证,以保证跑出来的条带是直线的(各样同时向前)。
做人做事要低调,默默践行心中的梦想.
8楼2011-08-13 14:49:04
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416114799

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

不液封并不会影响条带的数目,因此,可以试试。
做人做事要低调,默默践行心中的梦想.
9楼2011-08-13 14:50:51
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416114799

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
10楼: Originally posted by 韩俊 at 2011-08-14 13:38:45:
求教两个问题
1.那怎么样防止这个不均匀呢?
2.经常倒分离胶的时候会在小烧杯里剩下一点,但是往往板里的已经凝结了,不过小烧杯里的还是不凝结,这是为什么?

如果你的胶凝得很快,说明你的催化剂还是没有失效的,也有可能你加了太多,加了太多也会导致胶太硬,跑时往往容易烧胶,板里的分部比较均匀,凝得快是自然的(比较平,散得比较开)。这个与你的胶不均匀无关。
很多实验室的DNA胶都是回收利用的,用久了自然杂质也多,不知道你们是是否这样,如果不是的话,你可以摇匀点,加的时候快点,也尽量让胶出于一个水平面,高低不同的话,浓度自然不同,就不均匀了。
我觉得你花几天去摸索一下吧,把认为比较可能的原因做个实验。磨刀不误砍柴工啊
做人做事要低调,默默践行心中的梦想.
11楼2011-08-14 19:37:43
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416114799

至尊木虫 (知名作家)

不好意思,另一个人是DNA电泳胶,我也回答了,搞错了,重新说明一下。
还是那个意思,你先做个不液封的试试,看看是否有稀释的可能。
至于如何做到均匀,这个得靠自己的经验去摸索,别人说的其实都只是理论而已,与实际还是有差距的。
①、如果是用bio-rad,一般卡板比较好解决问题,这个卡板过程一般不导致不均匀;但是如果是国产的,比如六一牌电泳仪,那卡板就很关键了,卡不紧会漏胶,太紧了就会导致两边的胶比中间的薄,自然就不均匀了,所以这个比较难办;
②、尽量在温度高一些时凝胶,温度太低,凝得就慢,分子运动自然会导致不均匀;
③、保证药品的有效性,特别是APS,包括国药牌的,其实质量都一样,最好按量分装,比如10%的APS,你可以称0.5g或1gAPS分装于小离心管中,要用时随时配,一定要干燥保存;
只要克服了以上问题,一般是可以解决的
做人做事要低调,默默践行心中的梦想.
12楼2011-08-14 19:53:56
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416114799

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

我自己在做的时候就发现,胶不均匀影响非常大的,另外,跑时不要把电压调太低或太高,太低了无法分离,太高了容易烧胶。往往是先调低一些,比如120V,10min,让条带聚在一起,然后调到150V,这样出来的条带就非常细,非常漂亮。电压不稳定容易导致拖带,甚至笑脸等
做人做事要低调,默默践行心中的梦想.
13楼2011-08-14 19:59:41
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