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bxguang130金虫 (小有名气)
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[求助]
以靶酶结合腔设计并合成的小分子抑制剂，细胞水平活性很好，但该酶水平上很差，疑问
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以靶酶结合腔设计并合成的小分子抑制剂，细胞水平活性很好，但酶水平上很差，疑问 设计并合成了一类小分子酶抑制剂，并做了DS，模拟结果还可以，现在该类化合物对多个肿瘤细胞系抑制效果都还不错，1微摩左右吧，但对多个该类激酶在酶水平上的抑制活性比较差，10微摩以上，推测也许作用了其他信号传导途径或未知靶酶。 请问熟悉分子模拟的朋友们，怎样能从少数的活性好的小分子化合物出发，找寻与之能选择性结合的靶酶？有没有已知的酶库进行化合物识别对接的手段或方法？若有，国内哪儿有？ 相信做药化的朋友可能会经常碰到类似问题，希望大家踊跃发言，谢谢啦！ [ Last edited by ghcacj on 2011-8-12 at 10:35 ] |
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【答案】应助回帖
★ ★ ★
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-08-11 20:54:41
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-08-11 20:54:41
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还有这个程序也可以试试，http://bidd.nus.edu.sg/group/softwares/invdock.htm 都是在线的工具，上面是药物所开发的，下面是新国大的陈宇综老师开发的。 |
3楼2011-08-11 14:35:01
【答案】应助回帖
★ ★
bxguang130(金币+5): 对下步工作起到了导向作用 2011-08-11 20:03:02
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-08-11 20:54:51
bxguang130(金币+5): 对下步工作起到了导向作用 2011-08-11 20:03:02
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-08-11 20:54:51
| http://www.dddc.ac.cn/tarfisdock/index.php 试试这个，反向对接的。 |
2楼2011-08-11 14:02:25
tjegg
铁杆木虫 (著名写手)
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5楼2011-08-13 08:20:09
bxguang130
金虫 (小有名气)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 967.7
- 红花: 4
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- 虫号: 418503
- 注册: 2007-07-02
- 性别: GG
- 专业: 药物化学
6楼2011-08-15 17:30:54
10