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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » TRAP分子标记，这胶有问题请教（有图为证）
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墨池

银虫 (小有名气)

[求助] TRAP分子标记，这胶有问题请教（有图为证）

1   TRAP分子标记，跑在最前端发红色的带是扩增条带吗？（图1）
2   SRAP分子标记前端也有红色的带（图2），但比较少，只是个别泳道存在。为什么TRAP标记多而SRAP标记少呢？
3   有人知道SRAP标记扩增条带的分子量主要是在哪个范围内，我的MARKER是100-3000的。

谢谢(*^__^*) 嘻嘻……
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1楼 2011-08-09 18:45:19
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by 墨池 at 2011-08-11 22:02:22:
您的答案偶看不懂呀
1  SRAP扩增基于内含子和外显子的序列特征的共性，但有些并不能体现在EST和mRNA水平
2  分子量标记：1kb以下；我问的是SRAP标记的分子量范围。
3  红色条带可能是单链DNA。除了这个可能性 ...

红的肯定不是单链DNA，又不是变性PAGE，不可能是单链！红的我估计是染胶的问题，我的胶有时跑到下面就容易染成黄色或者红色！
SRAP我一般不固定范围，不过我觉得50bp到1000bp之内都可以用
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真相是最大的奢侈品
10楼2011-11-26 21:21:24
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duke01361

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

1949stone(MolEPI+1): 2011-08-10 17:12:36
墨池(金币+4): 2011-08-16 19:36:46
查查就知道了！TRAP和SRAP用的引物不同，所以pcr所得到的带型谱图就不同，TRAP针对这更多的共显性功能基因，所以真正表达的基因数目要比SRAP少的多。SRAP扩增基于内含子和外显子的序列特征的共性，但有些并不能体现在EST和mRNA水平，所以后者条带多，前者条带少。分子量标记：1kb以下；红色条带可能是单链DNA。
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观音菩萨信徒myblog:http://blog.sciencenet.cn/u/duke01361
2楼2011-08-10 12:43:19
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duke01361

铜虫 (小有名气)
1949stone: 还有epi呢 2011-08-10 17:12:50
等着你那20金币
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观音菩萨信徒myblog:http://blog.sciencenet.cn/u/duke01361
3楼2011-08-10 14:10:40
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)
引用回帖:
3楼: Originally posted by duke01361 at 2011-08-10 14:10:40:
等着你那20金币

你那心形的眼睛盯的是金币还是MM的头像呢？

开个玩笑，偶是帮你催楼主发金币的。
赞一下 回复此楼
5楼2011-08-11 12:13:07
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