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墨池

银虫 (小有名气)

[求助] TRAP分子标记,这胶有问题请教(有图为证)

1   TRAP分子标记,跑在最前端发红色的带是扩增条带吗?(图1)
2   SRAP分子标记前端也有红色的带(图2),但比较少,只是个别泳道存在。为什么TRAP标记多而SRAP标记少呢?
3   有人知道SRAP标记扩增条带的分子量主要是在哪个范围内,我的MARKER是100-3000的。

谢谢(*^__^*) 嘻嘻……


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阳光暖暖的,心情暖暖的,努力做个精致的女人!
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duke01361

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

1949stone(MolEPI+1): 2011-08-10 17:12:36
墨池(金币+4): 2011-08-16 19:36:46
查查就知道了!TRAP和SRAP用的引物不同,所以pcr所得到的带型谱图就不同,TRAP针对这更多的共显性功能基因,所以真正表达的基因数目要比SRAP少的多。SRAP扩增基于内含子和外显子的序列特征的共性,但有些并不能体现在EST和mRNA水平,所以后者条带多,前者条带少。分子量标记:1kb以下;红色条带可能是单链DNA。
观音菩萨信徒myblog:http://blog.sciencenet.cn/u/duke01361
2楼2011-08-10 12:43:19
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duke01361

铜虫 (小有名气)

1949stone: 还有epi呢 2011-08-10 17:12:50
等着你那20金币
观音菩萨信徒myblog:http://blog.sciencenet.cn/u/duke01361
3楼2011-08-10 14:10:40
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xbl3688

银虫 (正式写手)

生活的乐趣在于善于发现美,学会欣赏美
4楼2011-08-10 19:59:24
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

引用回帖:
3楼: Originally posted by duke01361 at 2011-08-10 14:10:40:
等着你那20金币

你那心形的眼睛盯的是金币还是MM的头像呢?

开个玩笑,偶是帮你催楼主发金币的。
5楼2011-08-11 12:13:07
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墨池

银虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 西瓜 at 2011-08-11 12:13:07:
你那心形的眼睛盯的是金币还是MM的头像呢?

开个玩笑,偶是帮你催楼主发金币的。

西瓜大人很无聊是吧,回家陪老婆去吧
阳光暖暖的,心情暖暖的,努力做个精致的女人!
6楼2011-08-11 21:15:50
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 墨池 at 2011-08-11 21:15:50:
西瓜大人很无聊是吧,回家陪老婆去吧

我也想早点下班回家啊
问题解决了没?搞定了我就取消置顶了哦。
7楼2011-08-11 21:36:38
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墨池

银虫 (小有名气)

西瓜: 2楼的回答有帮助的话,可以适当奖励哦 2011-08-11 22:03:06
引用回帖:
7楼: Originally posted by 西瓜 at 2011-08-11 21:36:38:
我也想早点下班回家啊
问题解决了没?搞定了我就取消置顶了哦。

没有额,求求留情啊
阳光暖暖的,心情暖暖的,努力做个精致的女人!
8楼2011-08-11 21:58:53
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墨池

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by duke01361 at 2011-08-10 12:43:19:
查查就知道了!TRAP和SRAP用的引物不同,所以pcr所得到的带型谱图就不同,TRAP针对这更多的共显性功能基因,所以真正表达的基因数目要比SRAP少的多。SRAP扩增基于内含子和外显子的序列特征的共性,但有些并不能 ...

您的答案偶看不懂呀
1  SRAP扩增基于内含子和外显子的序列特征的共性,但有些并不能体现在EST和mRNA水平
2  分子量标记:1kb以下;我问的是SRAP标记的分子量范围。
3  红色条带可能是单链DNA。除了这个可能性,还有别的么?为什么会有单链DNA?
阳光暖暖的,心情暖暖的,努力做个精致的女人!
9楼2011-08-11 22:02:22
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by 墨池 at 2011-08-11 22:02:22:
您的答案偶看不懂呀
1  SRAP扩增基于内含子和外显子的序列特征的共性,但有些并不能体现在EST和mRNA水平
2  分子量标记:1kb以下;我问的是SRAP标记的分子量范围。
3  红色条带可能是单链DNA。除了这个可能性 ...

红的肯定不是单链DNA,又不是变性PAGE,不可能是单链!红的我估计是染胶的问题,我的胶有时跑到下面就容易染成黄色或者红色!
SRAP我一般不固定范围,不过我觉得50bp到1000bp之内都可以用
真相是最大的奢侈品
10楼2011-11-26 21:21:24
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