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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 测序后总的碱基数多了一个
汕头大学海洋科学接受调剂
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happywoheni

铁虫 (小有名气)

[求助] 测序后总的碱基数多了一个

基因克隆测序后，比对了一下，有两个位置多出1个碱基，一个位置少了一个碱基，总共多出一个碱基，怎么回事？
我克隆的是原核基因
碱基数一定是3的倍数吗？我的序列多出一个来，三个一组，那氨基酸全部都发生改变了吗？
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1楼 2011-08-01 10:09:40
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zgb1982

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

happywoheni(金币+1): 2011-08-01 12:44:05
测序也可能会出错的
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2楼2011-08-01 11:48:08
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
西瓜(金币+2): good 2011-08-01 16:55:00
重新挑单菌落测序看看。
另外你还要看看测序图，有时候给的序列和图上的序列还是有点区别的，特别是连续同一个碱基的。
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3楼2011-08-01 11:59:28
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happywoheni

铁虫 (小有名气)
那如果我按那个出错了的提交到NCBI，还能改吗？
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4楼2011-08-01 12:43:46
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jinkui960

至尊木虫 (知名作家)
引用回帖:
4楼: Originally posted by happywoheni at 2011-08-01 12:43:46:
那如果我按那个出错了的提交到NCBI，还能改吗？

可以修改的，如果你确定了正确的序列以后，发邮件给GenBank的邮箱就可以了，GenBank的工作人员会帮你进行序列改正，相关的邮件地址在网站上可以找到。
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5楼2011-08-01 13:57:32
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jinkui960

至尊木虫 (知名作家)
★ ★ ★ ★
西瓜(金币+4): 很热心，两贴一起奖励 2011-08-01 16:55:30
引用回帖:
1楼: Originally posted by happywoheni at 2011-08-01 10:09:40:
基因克隆测序后，比对了一下，有两个位置多出1个碱基，一个位置少了一个碱基，总共多出一个碱基，怎么回事？
我克隆的是原核基因
碱基数一定是3的倍数吗？我的序列多出一个来，三个一组，那氨基酸全部都发生改变 ...

这是测序经常出现的问题，多测两个质粒，检查是不是测序错误，同时结合测序彩图对序列有错误的地方进行校正。
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6楼2011-08-01 13:59:52
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happywoheni

铁虫 (小有名气)
非常感谢楼上
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7楼2011-08-01 14:28:21
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