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il701木虫 (著名写手)
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为什么我的gaussian文件计算最终都是非正常结束，而且没有gibbs自由能这一项。
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我是菜鸟，不是计算化学专业的。最近要计算以下几种化合物的gibbs能。计算时输入文件的格式都是一样的，但是除了4和5能正常结束外（我一般找的是log文件最后一行里的Normal termination of Gaussian 03 at 。。。。），其它都不能正常结束，而非正常结束就没有gibbs能（不正常的log文件和相应的输入文件com见附件）。不知道哪里出了问题，是输入格式不对（五个文件都是一样的格式啊），不是结构不对，求高手指点。 我是在自己的电脑上先建好com文件，再提交给中科院计算机网络信息中心计算的。 我用的输入文件格式如下： +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ %mem=2000MB %nprocshared=8 # opt=gdiis freq=noraman b3lyp/6-31+g(d,p) geom=connectivity Title Card Required 0 1 C -4.82967800 -0.63082800 -0.00002600 C -3.61709700 0.30179200 -0.00000200 H -4.80529600 -1.27891000 0.88545300 H -4.80529100 -1.27887300 -0.88553300 C -2.29119700 -0.46844600 -0.00001400 H -3.67378500 0.95475100 -0.87980400 H -3.67379100 0.95471400 0.87982700 H -2.24945100 -1.12726100 0.87942200 H -2.24944500 -1.12722400 -0.87947800 C -1.06260900 0.45105500 0.00000900 C 0.26574600 -0.31622000 -0.00000300 H -1.10258200 1.10921900 0.87887400 H -1.10257600 1.10925600 -0.87882900 C 1.47901300 0.61445300 0.00002000 H 0.30923800 -0.97036700 0.88243100 H 0.30924400 -0.97033100 -0.88246400 H 1.45675700 1.26864700 -0.88037500 H 1.45675100 1.26861200 0.88044100 N 2.71807400 -0.15491600 0.00000700 N -6.06570700 0.12785200 -0.00001400 C -7.25937700 -0.03397800 -0.00002300 O -8.44226400 -0.05999400 -0.00002700 C 3.93627400 0.44817000 0.00001700 O 4.12017700 1.65627700 0.00002300 O 4.93091600 -0.48362500 0.00001000 C 6.27973000 0.03812400 0.00001000 H 6.41485000 0.66824200 0.88447600 H 6.41484900 0.66824200 -0.88445600 C 7.22588500 -1.14813200 0.00001000 H 7.07613100 -1.77024200 -0.88780700 H 7.07613200 -1.77024200 0.88782600 H 2.68936700 -1.16366300 0.00000900 C 8.68233738 -0.64778566 0.00000859 C 9.64009190 -1.80253946 -0.00000048 H 8.83200940 -0.01003615 0.90493367 H 8.83200120 -0.00995207 -0.90485133 H 10.69667511 -1.44003927 -0.00006150 H 9.49007066 -2.44018490 0.90497444 H 9.49001387 -2.44024116 -0.90492456 1 2 1.0 3 1.0 4 1.0 20 1.0 2 5 1.0 6 1.0 7 1.0 3 4 5 8 1.0 9 1.0 10 1.0 6 7 8 9 10 11 1.0 12 1.0 13 1.0 11 14 1.0 15 1.0 16 1.0 12 13 14 17 1.0 18 1.0 19 1.0 15 16 17 18 19 23 1.5 32 1.0 20 21 2.0 21 22 2.0 22 23 24 2.0 25 1.0 24 25 26 1.0 26 27 1.0 28 1.0 29 1.0 27 28 29 30 1.0 31 1.0 33 1.0 30 31 32 33 34 1.0 35 1.0 36 1.0 34 37 1.0 38 1.0 39 1.0 35 36 37 38 39 +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++[ Last edited by il701 on 2011-7-20 at 21:22 ] |
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附件5 Job cpu time: 0 days 3 hours 20 minutes 6.1 seconds. File lengths (MBytes): RWF= 129 Int= 0 D2E= 0 Chk= 18 Scr= 1 Normal termination of Gaussian 03 at Wed Jul 20 17:06:07 2011. Link1: Proceeding to internal job step number 2. --------------------------------------------------------------------- #N Geom=AllCheck Guess=Read SCRF=Check GenChk RB3LYP/6-31+G(d,p) Freq 附件6 Job cpu time: 0 days 7 hours 8 minutes 52.7 seconds. File lengths (MBytes): RWF= 145 Int= 0 D2E= 0 Chk= 20 Scr= 1 Normal termination of Gaussian 03 at Wed Jul 20 18:11:36 2011. Link1: Proceeding to internal job step number 2. --------------------------------------------------------------------- #N Geom=AllCheck Guess=Read SCRF=Check GenChk RB3LYP/6-31+G(d,p) Freq --------------------------------------------------------------------- |
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