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il701

木虫 (著名写手)

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[求助] 为什么我的gaussian文件计算最终都是非正常结束，而且没有gibbs自由能这一项。

我是菜鸟，不是计算化学专业的。最近要计算以下几种化合物的gibbs能。计算时输入文件的格式都是一样的，但是除了4和5能正常结束外（我一般找的是log文件最后一行里的Normal termination of Gaussian 03 at 。。。。），其它都不能正常结束，而非正常结束就没有gibbs能（不正常的log文件和相应的输入文件com见附件）。不知道哪里出了问题，是输入格式不对（五个文件都是一样的格式啊），不是结构不对，求高手指点。

我是在自己的电脑上先建好com文件，再提交给中科院计算机网络信息中心计算的。
我用的输入文件格式如下：
+++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
%mem=2000MB
%nprocshared=8
# opt=gdiis freq=noraman b3lyp/6-31+g(d,p) geom=connectivity

Title Card Required

0 1
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N                2.71807400 -0.15491600 0.00000700
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H                8.83200940 -0.01003615 0.90493367
H                8.83200120 -0.00995207 -0.90485133
H                10.69667511 -1.44003927 -0.00006150
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1 2 1.0 3 1.0 4 1.0 20 1.0
2 5 1.0 6 1.0 7 1.0
3
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5 8 1.0 9 1.0 10 1.0
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11 14 1.0 15 1.0 16 1.0
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1楼 2011-07-20 21:15:58

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gmy1990

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【答案】应助回帖

il701(金币+10): 那应该怎么操作，我用bjobs命令显示是所有job都已经结束啊？高手帮忙！！！ 2011-07-21 08:48:26

什么叫做都非正常结束？明明就还没结束，附件5和6都已经收敛找到能量稳定点了，在算频率呐.

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2楼2011-07-20 21:47:02

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gmy1990

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附件5
Job cpu time:  0 days  3 hours 20 minutes  6.1 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF= 129 Int=    0 D2E=    0 Chk=    18 Scr=    1
Normal termination of Gaussian 03 at Wed Jul 20 17:06:07 2011.
Link1:  Proceeding to internal job step number  2.
---------------------------------------------------------------------
#N Geom=AllCheck Guess=Read SCRF=Check GenChk RB3LYP/6-31+G(d,p) Freq
附件6
Job cpu time:  0 days  7 hours  8 minutes 52.7 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF= 145 Int=    0 D2E=    0 Chk=    20 Scr=    1
Normal termination of Gaussian 03 at Wed Jul 20 18:11:36 2011.
Link1:  Proceeding to internal job step number  2.
---------------------------------------------------------------------
#N Geom=AllCheck Guess=Read SCRF=Check GenChk RB3LYP/6-31+G(d,p) Freq
---------------------------------------------------------------------

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3楼2011-07-20 21:52:49

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