24小时热门版块排行榜    

查看: 2786  |  回复: 13
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

hnuzhoulin

金虫 (小有名气)

[求助] 原来编译的siesta突然不能用,重新编译没错,运行出错

前几天才尝试用gfortran和mpich2编译siesta,通过了,并且在test目录和example、目录下都能够计算得到差不多的结果。由于当时安装的mpich2用的是mpd,后来改用新版的mpich2换hydra作为进程调度的系统,于是重新编译了一下:这次尝试用ifort10+mpich2,编译过程没什么错误,但是在test目录下make,得到的错误如下:
CODE:
[zhoulin@cluster h2o]$ make
>>>> Running h2o test...
    ==> Copying pseudopotential file for H...
    ==> Copying pseudopotential file for O...
    ==> Running SIESTA as ../../../Src/siesta
forrtl: severe (174): SIGSEGV, segmentation fault occurred
Image              PC                Routine            Line        Source            
libmkl_mc3.so      00002B54A3C4CF8F  Unknown               Unknown  Unknown
make: *** [completed] Error 174

于是我将可执行文件拷贝到第一次正确运行(gfortran编译成功那次)的目录,再次  ./siestaCODE:
initatom: Reading input for the pseudopotentials and atomic orbitals ----------
Species number:            1  Label: O Atomic number:           8
Species number:            2  Label: H Atomic number:           1
Ground state valence configuration:   2s02  2p04
Reading pseudopotential information in formatted form from O.psf
Semicore shell(s) with -5 electrons included in the valence for
O
Ground state valence configuration:   1s01
Reading pseudopotential information in formatted form from H.psf
O                    must be in PAO.Basis (it has semicore states)
Stopping Program from Node:    0
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 0
[unset]: aborting job:
application called MPI_Abort(MPI_COMM_WORLD, 1) - process 0

不明白啊,为啥编译没问题,运行却出错??

还有曾经还编译出一个版本,在前台可以算,rocks集群系统交到后台有进程,但是不计算,郁闷啊。

求教。

[ Last edited by hnuzhoulin on 2011-7-19 at 16:02 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

first principle

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

identation

金虫 (著名写手)

★ ★
youzhizhe(金币+2): 谢谢交流。 2011-07-21 13:23:59
这个程序真是让人纠结 安装相对于用户这么不友好 我为了装它导致其他程序都无法运行了 还得重装系统
2楼2011-07-19 20:22:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 hnuzhoulin 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 只想摆烂 +7 s150535912 2024-12-23 9/450 2024-12-23 15:17 by hzwdzdf
[职场人生] 网络游戏有意义吗 +4 神明.斯派克. 2024-12-16 4/200 2024-12-23 15:15 by 开心就好56
[文学芳草园] 生活的意义 +5 宋昙 2024-12-20 5/250 2024-12-23 14:37 by yuan0806
[考博] 读博的欲望达到了巅峰 +17 小丸九 2024-12-17 17/850 2024-12-23 11:35 by s150535912
[教师之家] 在学校是提拔成处长难度大还是教授难度大 +10 akslis2024 2024-12-17 13/650 2024-12-23 11:05 by 会飞的猪157
[找工作] 柔引引进博士硕士。 +21 大发财树 2024-12-18 22/1100 2024-12-23 09:32 by Demo呆萌
[考博] 求老师哦! +5 景小凯 2024-12-20 5/250 2024-12-23 08:58 by 19881327
[硕博家园] 柔性引进硕博人才 +7 大发财树 2024-12-20 7/350 2024-12-23 02:32 by upceric
[论文投稿] Required Reviews Completed +9 驴哈哈 2024-12-20 10/500 2024-12-22 20:58 by 凌晨一点393
[功能材料] 请教大神,带隙是DFT计算出来的还是实验测出来的? 10+3 大力2010 2024-12-21 6/300 2024-12-22 18:08 by Ayase_lumi
[考博] 想找一位年轻的985博导 +6 艾弗森迪尔 2024-12-21 7/350 2024-12-22 09:33 by 飞翔和星辰
[论文投稿] 投稿期刊 5+4 王丽媛西西西 2024-12-17 7/350 2024-12-22 04:44 by yudaoqian88
[教师之家] 今年的科研绩效只奖励Q1了 +12 holypower 2024-12-20 17/850 2024-12-21 16:13 by willbuilder
[考博] 有偿聘请兼职硕士 +10 大发财树 2024-12-19 10/500 2024-12-20 17:30 by mopsite
[论文投稿] Transportation Research Part C 投稿模板 5+3 Yetzirah 2024-12-20 4/200 2024-12-20 16:32 by 北京莱茵润色
[论文投稿] 投稿投错期刊,怎么撤稿? 200+4 birrd 2024-12-17 8/400 2024-12-20 14:53 by yiran909
[有机交流] 请问液溴开封后没有密封,放一年会变质吗? +9 rommel1975 2024-12-16 9/450 2024-12-20 11:01 by 2005127239
[教师之家] 某老师在组会上总是针对我带的学生怎么办? +15 lice_1987 2024-12-17 23/1150 2024-12-20 04:50 by 胖胖的大海
[教师之家] 删了哦 (EPI+-1)(金币-50) +5 原因在哪里 2024-12-18 6/300 2024-12-19 12:25 by keikofans
[论文投稿] 申博 +3 翟某人 2024-12-16 3/150 2024-12-17 09:24 by xs74101122
信息提示
请填处理意见