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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 热点前沿问题讨论 » [软件编译交流]如下的编译问题你了解多少？
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uuv2010

荣誉版主 (职业作家)

[交流] [软件编译交流]如下的编译问题你了解多少？


在linux下的计算，第一步就是需要编译相应的计算软件（或许师兄师姐已经帮助编译好了），然后才是用来做具体的计算。关于软件编译，大家了解到什么程度？对于下面这几个问题，大家来测试一下吧。回答问题有金币奖励哦~欢迎补充相关问题，欢迎补充相应的答案~  
推荐一本关于makefile的文档《跟我一起写 Makefile》，大家有空看以看看，链接如下：http://www.chinaunix.net/jh/23/408225.html

一、关于ifort
1. FFLAGS =  -FR
                     -lowercase
                     -assume byterecl  
                     -heap-arrays
上述编译选项分别代表什么意义？有什么用途？（每个选项10个金币）

2. OFLAG的选项O1, O2, O3等三个优化选项分别有什么优势和劣势？怎样针对自己的体系进行选择？（每个选项10个金币）

二、关于mkl
1.对于intel64而言，下列这几个选项分别代表什么意义？起什么作用？
-lmkl_intel_lp64
-lmkl_sequential
-lmkl_scalapack_lp64  
-lmkl_blacs_openmpi_lp64
-lmkl_lapack95_lp64
-lmkl_core
-lrt
-lsvml
-limf
-lm（每个选项10个金币）

2.对于em64t而言 ， 下列这几个选项分别代表什么意义？起什么作用？（每个选项10个金币）
-lmkl_em64t
-lguide
-lpthread
-limp
-lm  

三、关于mpif90
下列这几个选项分别代表什么意义？起什么作用？需要赋值的选项分别赋多大值合适？（每个选项10个金币）
-DCACHE_SIZE=4000
-DPGF90 -Davoidalloc
-DMPI_BLOCK=8000



[ Last edited by uuv2010 on 2012-2-11 at 15:16 ]
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1楼2012-02-11 15:08:00
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WDD880227

木虫 (正式写手)
顶起~~！！
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2楼2012-02-11 15:11:37
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souledge

专家顾问 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
uuv2010(金币+2): 多谢很好的建议！上述问题是vasp的一些编译参数，呵呵，欢迎补充问题，欢迎回答问题，非常感谢！ 2012-02-11 15:39:44
怎么都是ifort的啊，并且这些都是编译VASP时重要的编译参数～
也来几个其他编译器的吧，比如PGI的或者PathScale的～仅仅是ifort的免费版可使用的范围有点小啊～
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3楼2012-02-11 15:34:05
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uuv2010

荣誉版主 (职业作家)
引用回帖:
3楼: Originally posted by souledge at 2012-02-11 15:34:05:
怎么都是ifort的啊，并且这些都是编译VASP时重要的编译参数～
也来几个其他编译器的吧，比如PGI的或者PathScale的～仅仅是ifort的免费版可使用的范围有点小啊～

好啊，欢迎补充具体问题啊
免费版的ifort也是很强大的，呵呵
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4楼2012-02-11 15:35:24
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souledge

专家顾问 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by uuv2010 at 2012-02-11 15:35:24:
好啊，欢迎补充具体问题啊
免费版的ifort也是很强大的，呵呵

俺是说让版主补充问题，最好还能顺便提供答案……
ifort的确很强大，在x86构架的Linux中，暂时还没发现哪个编译器的兼容性能比它强的～
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5楼2012-02-11 15:37:45
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uuv2010

荣誉版主 (职业作家)
集思广益，共同解决问题~
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6楼2012-02-11 15:41:53
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锐利的碎片

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
不觉得有什么好讨论的，ifort 编译选项意义 用 ifort --help看就行了，引用了外部库函数当然要加库的路径。预处理参数知道就好了，你要想知道编译器在干嘛，可以讲一学期，但对计算真的没什么用。
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8楼2012-02-11 17:05:49
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 锐利的碎片 at 2012-02-11 17:05:49:
不觉得有什么好讨论的，ifort 编译选项意义 用 ifort --help看就行了，引用了外部库函数当然要加库的路径。预处理参数知道就好了，你要想知道编译器在干嘛，可以讲一学期，但对计算真的没什么用。

他总是这么酷~~
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11楼2012-02-13 09:07:15
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uuv2010

荣誉版主 (职业作家)
★ ★
zzy870720z(金币+2): 鼓励交流，不错哦 2012-03-03 08:31:52
关于O1、O2、O3等参数，ifort的help文档是如下说明的：
-O1    optimize for maximum speed, but disable some optimizations which
       increase code size for a small speed benefit. （最大速度的优化）
-O2    enable optimizations (DEFAULT)     （增强优化，这个是默认选项）
-O3    enable -O2 plus more aggressive optimizations that may not improve
       performance for all programs  
-O0    disable optimizations （不优化）
-O     same as -O2     （默认选项，同O2）

[ Last edited by uuv2010 on 2012-2-13 at 09:30 ]
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12楼2012-02-13 09:27:24
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iamikaruk

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
uuv2010(金币+2): 是的，呵呵 2012-02-13 21:30:28
uuv2010(金币+2): 可做过O1,O2,O3的对比测试？ 2012-02-13 21:31:57
一般就-O2，省心又省力
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13楼2012-02-13 20:40:38
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aabbc1122

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
uuv2010(金币+10): 赞！ 2012-02-13 21:30:51
Intel的EM64T技术，EM64T技术官方全名是Extended Memory 64 Tenchnology 中文解释就是扩展64bit内存技术。现在的32位奔腾 4 CPU都是采用IA-32指令集，EM64T其实就是在这个指令集的基础上进行扩展，我们将它命名为IA32e。Intel这种实现64位的方法其实和AMD的x86-64技术有异曲同工之妙，都是通过64位扩展指令来实现兼容32位和64位的运算。另外不同的是Intel的EM64T技术设定了IA-32和IA-32e两种模式的激活程序，就是说EM64T需要满足特定条件才会激活。
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14楼2012-02-13 20:52:04
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aabbc1122

木虫 (正式写手)
★ ★
zzy870720z(金币+2): 鼓励交流，但好像有点文不对题吧，呵呵 2012-03-03 08:33:12
下面是一个使用Intel MKL 进行矩阵计算的例子。 通过的这个例子，我们可以了解如何使用Intel MKL 的函数库：  

1>程序说明：下面的matrix.c 文件分别调用 C 代码，Intel MKL BLAS Level 1 函数 (ddot), BLAS Level 2 函数(dgemv) 与 BLAS Level 3的函数(DGEMM)完成矩阵计算： roll_your_own_multiply 是 C 源代码，它直接依赖编译器生成优化代码。Ddot_Multiply，Dgemv_multiply使用Intel MKL 函数实现部分矩阵运算。Dgemm_multiply 直接调用MKL 的矩阵计算函数。

2>程序编译与链接：


下面是在Linux 32 的系统上，使用Intel Compiler编译该程序并链接Intel MKL 10.0的例子：
> source /opt/intel/cc/10.x.xxx/bin/iccvars.sh #设置Intel Compiler 环境变量
> icl –o matrix –I/opt/intel/mkl/10.0.xxxxx/include/ matrix.c-L/opt/intel/mkl/10.0.xxxx/lib/32/ -lmkl_intel_c -lmkl_intel_thread -lmkl_core -lguide40.lib –lpthread   

其他的链接的方式，大家可以查看下面的帖子：http://support.intel.com/support ... ls/sb/CS-028699.htm
   
3> 程序执行：  
> source /opt/intel/mkl/10.0.xxxxx/tools/environment/mklvars32.sh #程序使用动态方式链接MKL函数时，设置MKL的环境变量。
>./matrix   
   
4> 设置多线程运行：在Intel MKL 10.0 使用OpenMP* 实现多线程。 OpenMP*程序可以通过环境变量 OMP_NUM_THREADS 去控制线程的数目。  
  > export OMP_NUM_THRADS=4 #设置程序的线程为 4
  > ./matrix #DGEMM在执行的时候使用4个线程。

注意：在MKL 10.0 中， 如果OMP_NUM_THREADS没有定义，MKL函数可能会根据数据的大小，以及其他的变量来设置线程数目， 缺省时，可能运行多个线程运行。  

源程序下载的URL:
http://download355.mediafire.com ... hflsx1md/testcode.c
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15楼2012-02-13 20:53:56
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aabbc1122

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
zzy870720z(金币+2): 谢谢分享，呵呵 2012-03-03 08:33:26
安装icc和ifort：
在Intel网站下载9.1.047版icc（我是没安装，可以不装）和9.1.043版ifort，然后按网站要求申请许可证，并按提示进行安装即可，我都是全部安装的。基本上10版本的ifort安装很方便就完成的。重 要一点就是必须先建立ifort的安装目录，并且把lincese文件复制进入对应目录里。

1、 把icc和ifort的路径加入到环境变量中：
把安装目录下bin文 件夹中的iccvars.sh和ifortvars.sh拷贝到/etc/profile.d中。

这个很重要，作了就可以进行下面的MPI的配置和MAKE了，否则死都过不去！

2、 卸载
按照说明说的介绍，PDF里有介绍如何卸载的

第四 品  配置ssh:
1、 安装ssh
本来是可以不要的， 不过操作起来很简单，就顺手都给安装上了

yum install openssh openssh-server openssh-clients openssh-askpass

2、 编辑/etc/hosts，
这一步我觉得单机并行似乎可以不要，不过以前这么做的，没有问题，所以 现在还这么做

加入一行：127.0.0.1 node01

c.启动sshd并自动生成密钥：

/etc/rc.d/init.d/sshd start

加入启动服务：

chkconfig --level 5 sshd on

d.限制其它人连接：两种做法：a.设置iptables，b.编辑/etc/hosts.deny和/etc/hosts.allow，

这两个文件的格式忘掉了，有需要的同学可以查一下。
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16楼2012-02-13 20:54:48
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ANDPing

荣誉版主 (文坛精英)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
linux现在很火啊，早知道偶当初也学这个了，那么现在就能帮到你了
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17楼2012-03-02 14:43:54
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逍遥游006

至尊木虫 (职业作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
都是人才啊！俺没看懂
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18楼2012-03-02 14:52:00
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future_wl

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
uuv2010: 金币+3, 是的，呵呵 2012-08-23 22:30:33
FFLAGS =  -FR
                     -lowercase
                     -assume byterecl  
                     -heap-arrays

俺只知道  -heap-arrays这个选项是控制堆栈大小的
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19楼2012-08-23 10:34:04
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Vaucanson

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
这些都是非常关键的参数，要是有大神讲讲就好了
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20楼2014-12-08 10:49:33
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buctsheng7楼
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I_Gabriel9楼
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8楼: Originally posted by 锐利的碎片 at 2012-02-11 17:05:49: 不觉得有什么好讨论的，ifort 编译选项意义 用 ifort --help看就行了，引用了外部库函数当然要加库的路径。预处理参数知道就好了，你要想知道编译器在干嘛，可以讲一学期，但对计算真的没什么用。

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