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zhangzhaojin金虫 (初入文坛)
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siesta编译
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`FoX/FoX-config --libs --wcml` -L/home/hu/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t -lmkl_scalapack_lp64 -L/home/hu/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t -lmkl_blacs_openmpi_lp64 -L/home/hu/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t -lmkl_sequential -lmkl_core -L/home/hu/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t -lmkl_solver_lp64 -lmkl_intel_lp64 -lguide /home/hu/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t/libmkl_scalapack_lp64.a: could not read symbols: File format not recognized make: *** [siesta] 错误 1 在make时 出现这个问题 我在lib里发现有libmkl_scalapack_lp64.a 但为什么会出现这种情况 请指点 谢谢 |
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hnuzhoulin
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franch(金币+3): 谢谢回帖交流 2011-10-31 20:59:54
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诶，肯定是库文件问题， 楼主贴一下arch.make文件出栏看看吧 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
2楼2011-10-31 14:12:23
zhangzhaojin
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送鲜花一朵
fzx2008(金币+2): 谢谢指教 2011-11-01 21:46:10
送鲜花一朵fzx2008(金币+2): 谢谢指教 2011-11-01 21:46:10
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# # This file is part of the SIESTA package. # # Copyright (c) Fundacion General Universidad Autonoma de Madrid: # E.Artacho, J.Gale, A.Garcia, J.Junquera, P.Ordejon, D.Sanchez-Portal # and J.M.Soler, 1996- . # # Use of this software constitutes agreement with the full conditions # given in the SIESTA license, as signed by all legitimate users. # .SUFFIXES: .SUFFIXES: .f .F .o .a .f90 .F90 SIESTA_ARCH=Ifort(10.1.021)+MKL(10.0.2.018)+OpenMPI(1.2.6)@openSUSE-10.3_X86-64 FPP= FPP_OUTPUT= FC=mpif90 RANLIB=ranlib SYS=nag SP_KIND=4 DP_KIND=8 KINDS=$(SP_KIND) $(DP_KIND) FFLAGS= -O2 -i-static FFLAGS_DEBUG= -g LDFLAGS=-Vaxlib FPPFLAGS= -DFC_HAVE_FLUSH -DFC_HAVE_ABORT -DMPI ARFLAGS_EXTRA= FCFLAGS_fixed_f= FCFLAGS_free_f90= FPPFLAGS_fixed_F= FPPFLAGS_free_F90= BLAS_LIBS=-L/home/hu/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t -lmkl_solver_lp64 -lmkl_intel_lp64 -lguide LAPACK_LIBS=-L/home/hu/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t -lmkl_sequential -lmkl_core BLACS_LIBS=-L/home/hu/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t -lmkl_blacs_openmpi_lp64 SCALAPACK_LIBS=-L/home/hu/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t -lmkl_scalapack_lp64 COMP_LIBS= NETCDF_LIBS= NETCDF_INTERFACE= LIBS=$(SCALAPACK_LIBS) $(BLACS_LIBS) $(LAPACK_LIBS) $(BLAS_LIBS) $(NETCDF_LIBS) #SIESTA needs an F90 interface to MPI #This will give you SIESTA's own implementation #If your compiler vendor offers an alternative, you may change #to it here. MPI_INTERFACE= libmpi_f90.a MPI_INCLUDE=/home/hu/software/openmpi-1.2.6/include #Dependency rules are created by autoconf according to whether #discrete preprocessing is necessary or not. .F.o: $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FPPFLAGS) $(FPPFLAGS_fixed_F) $< .F90.o: $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FPPFLAGS) $(FPPFLAGS_free_F90) $< .f.o: $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FCFLAGS_fixed_f) $< .f90.o: $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FCFLAGS_free_f90) $< |
3楼2011-11-01 10:39:05
hnuzhoulin
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zhangzhaojin(金币+2): 2011-11-01 18:53:22
fzx2008(金币+1): 谢谢交流 2011-11-01 21:45:49
zhangzhaojin(金币+2): 2011-11-01 18:53:22
fzx2008(金币+1): 谢谢交流 2011-11-01 21:45:49
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COMP_LIBS=dc_lapack.a liblapack.a libblas.a SCALAPACK_LIBS=-L/home/zhn/intel/mkl/10.1.0.015/lib/em64t -lmkl_scalapack_lp64 -pthread 第一句你加一下，第二个的话其实最后一个-pthread不加没什么的，你姑且加一下吧。 然后我要说的是你的openmpi是用ifort编译的吗？ mpif90 -v 输出是什么？ |
4楼2011-11-01 13:14:47
zhangzhaojin
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5楼2011-11-01 18:52:59
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贺仪(金币+1): 多谢建议 2011-11-02 13:54:56
zhangzhaojin(金币+2): 2011-11-02 14:56:19
贺仪(金币+1): 多谢建议 2011-11-02 13:54:56
zhangzhaojin(金币+2): 2011-11-02 14:56:19
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晕，那么你的openmpi是用ifort编译的吗？？ 这里给你找了一个文档，你对照着在试一次吧 http://115.com/file/dnedhsiz# Siesta-TranSiesta-Smeagol-ATK安装笔记.pdf 最好是删除，重新解压再编译 |
6楼2011-11-02 12:33:21
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zhangzhaojin(金币+2): 2011-11-02 14:56:28
zzy870720z(金币+1): 谢谢建议 2011-11-03 20:14:12
zhangzhaojin(金币+2): 2011-11-02 14:56:28
zzy870720z(金币+1): 谢谢建议 2011-11-03 20:14:12
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改里面的为这个试试： BLAS_LIBS=-L/home/hu/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t -lmkl_solver_lp64 -lmkl_intel_lp64 -lmkl_blacs_openmpi_lp64 -lguide -pthread LAPACK_LIBS=-L/home/hu/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t -lmkl_sequential -lmkl_core SCALAPACK_LIBS=-L/home/hu/intel/mkl/10.0.2.018/lib/em64t -lmkl_scalapack_lp64 |
7楼2011-11-02 13:54:27
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8楼2011-11-02 14:40:40
zhangzhaojin
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但还是谢谢你啊 9楼2011-11-02 14:57:09
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zzy870720z(金币+1): 谢谢指教 2011-11-03 20:15:15
zzy870720z(金币+1): 谢谢指教 2011-11-03 20:15:15
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晕，没道理啊。 你把mkl库重新安装一下试一试？ 或者自己下载库自己编译库文件试一试？ 这些库都比较容易编译的啦。 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2420318&fpage=1 这里有喔，可以试一试 |
10楼2011-11-03 09:50:33
