| 查看: 4315 | 回复: 41 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
Gaussian几何优化后的键长不合理
|
||
|
用Gaussian 09做分子几何优化。分子的部分结构见图1，具有两个手性中心（C3和C6）。几何优化分步过程如下：先用chem3D MM2做初步优化，再用PM3优化（包括频率分析），接下来用RHF 6-31G做优化（包括频率分析），计算均成功完成。但是分子中的碳硫键C3-S1（图1），经PM3优化后，键长1.882埃，基本合理，经RHF 6-31G优化后竟然变成3.172埃，显然是不合理的。我的疑问如下： 我的这种分步优化应该是合理的吧？ 键长不合理的情况是否与分子中包含手性中心有关？因为C3是手性的，导致gaussian对碳硫键的处理不合理？（另一个手性中心C6周围的键长均在合理范围内） gaussian中对手性分子的几何优化有什么需要特别注意的吗？ 6-31G的基组对于处理硫这样的原子足够吗？ 补充：刚看到其他的帖子，认为初始分子的构型是否合理，对找到正确的优化结构很关键？那么我的分步优化产生的构型是否是比较合理的构型呢？  [ Last edited by jianqin on 2011-7-15 at 09:40 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
伦敦大学学院Benjamin Moss博士招收人工智能、原位光谱、催化相关26年博士生
已经有11人回复
-
中国科学院成都山地灾害与环境研究所2026年特别研究助理（博士后）招聘启事
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有138人回复
-
招生材料与化工、环境科学调剂研究生
已经有5人回复
-
湖南大学刘巧玲课题组2026年博士研究生招生信息
已经有28人回复
-
南方科技大学表面催化反应动力学研究课题组招收2026届博士生
已经有1人回复
-
北京邮电大学物理学院老师招收博士生
已经有3人回复
-
Comsol 6.0 桶内肥料产热产湿过程模拟求助
已经有1人回复
-
微纳hub，微纳加工的宝库
已经有0人回复
-
微纳加工里的 lift-off 工艺
已经有0人回复
-
面上再次挂了，太难了，躺也躺不了，倦也卷不过，小学校之殇！
已经有37人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
zhangmt
至尊木虫 (著名写手)
我叫MT
- QC强帖: 5
- 应助: 99 (初中生)
- 金币: 6961.8
- 散金: 10406
- 红花: 49
- 帖子: 1761
- 在线: 763.2小时
- 虫号: 880392
- 注册: 2009-10-22
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
20楼2011-07-18 12:17:53
fatpig8832
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 16 (小学生)
- 金币: 7420.2
- 散金: 31
- 红花: 28
- 帖子: 1438
- 在线: 610.9小时
- 虫号: 770403
- 注册: 2009-05-14
2楼2011-07-15 10:20:09
3楼2011-07-15 10:33:52
fatpig8832
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 16 (小学生)
- 金币: 7420.2
- 散金: 31
- 红花: 28
- 帖子: 1438
- 在线: 610.9小时
- 虫号: 770403
- 注册: 2009-05-14
4楼2011-07-15 12:00:35
40