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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 如何在amber里面添加多个分子？
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jj2006

木虫 (小有名气)

[求助] 如何在amber里面添加多个分子？

要用amber建立一个包含分子A：B：C=10：40：1000的混合盒子体系，但是在建模时使用了addions添加分子B，C到分子A中时出现错误，请教各位高手怎么在盒子里面添加多组分的混合体系，应该用哪个命令进行建模？
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1楼 2011-07-13 18:24:52
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匿名

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★
ghcacj(金币+1): 谢谢 2011-08-30 15:56:38
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7楼2011-08-30 13:27:28
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匿名

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★ ★
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-08-04 20:36:01
jj2006(金币+2): 2011-08-28 15:44:21
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2楼2011-08-04 11:09:49
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jj2006

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 小蜗牛8728 at 2011-08-04 11:09:49:
请问分别是什么分子，addions只能添加单个原子的离子。

a是抗生素，b是功能单体MAA，c是溶剂分子四氢呋喃！
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it‘snottimetomakeadecision，it'stimetomakemistakes！
3楼2011-08-28 15:33:38
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匿名

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★ ★
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-08-28 22:55:00
jj2006(金币+2): 谢谢，貌似有点高端，还没有到哪个级别！ 2011-10-27 19:47:39
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4楼2011-08-28 20:50:21
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