应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 溶剂中过渡态查找
71/1返回列表
查看: 1238  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

rulongxu

至尊木虫 (小有名气)

[求助] 溶剂中过渡态查找

请问在溶剂中进行过渡态查找应该用什么方法？非常感谢！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-07-12 08:46:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

独孤狼

金虫 (正式写手)

独行者

【答案】应助回帖

★ ★
gmy1990(金币+2): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-07-12 10:54:42
和气相中一样，加上溶剂修正即可
赞一下(1人) 回复此楼
轮回的过往，注定的未来；独孤的行者，孤独的路途……
2楼2011-07-12 10:12:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rulongxu

至尊木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 独孤狼 at 2011-07-12 10:12:44:
和气相中一样，加上溶剂修正即可

我做的是非均相反应。催化剂为固体，氯仿为溶剂。运行之后出错。
# m052x/sto-3g scrf=(iefpcm,solvent=8,read) opt=(calcfc,qst2) geom=connectivity

reactants

0 1
C                 -0.20104900   -3.07667200    0.80309200
C                  0.90945800   -2.29920400    0.13823400
C                  1.19584200   -0.98224500    0.87909900
C                  2.26971500   -0.17123100    0.17750300
C                 -1.12400000   -3.84865500    0.20099900
C                 -2.20850800   -4.53359100    1.00112900
C                 -1.19574300   -4.10982400   -1.28432600
C                  3.56605300   -0.37174600    0.48273300
C                  1.74122100    0.78975300   -0.86413700
C                  4.63584700    0.24162800   -0.05370000
C                  5.89226100   -0.06181600    0.32051700
C                  6.97834800    0.54682000   -0.22452200
C                  8.33390900    0.08280400    0.28611400
O                  6.91334500    1.40902300   -1.07195900
H                 -0.23777800   -2.99194400    1.90160300
H                  1.82685000   -2.93351000    0.14661300
H                  0.66372800   -2.06792100   -0.92164800
H                  0.26803400   -0.37200500    0.96430500
H                  1.51185600   -1.20388400    1.92562400
H                 -3.20941700   -4.19518200    0.64922300
H                 -2.14538900   -5.63790900    0.87380400
H                 -2.14894500   -4.31654300    2.09152600
H                 -1.19686000   -5.20670600   -1.47467600
H                 -2.13794500   -3.68713200   -1.70054500
H                 -0.34736700   -3.68960800   -1.86547400
H                  3.75960100   -1.13495800    1.25544900
H                  2.51904900    1.33815100   -1.43643700
H                  1.12053100    0.24499200   -1.61058600
H                  1.09761200    1.55682500   -0.37673000
H                  4.49080300    1.01140700   -0.82644500
H                  6.06647200   -0.83310000    1.09067100
H                  9.16092700    0.59573600   -0.25616300
H                  8.44244300    0.31213700    1.37080000
H                  8.45818300   -1.01332100    0.12967100
C                 -0.97111200    5.07203700   -0.29064200
C                 -2.42014000    4.61520000   -0.05449500
C                 -2.98120300    5.19397700    1.25470200
C                 -2.52287700    3.09844500   -0.07388400
C                 -3.26672200    2.46558400   -0.99864400
C                 -3.35017300    1.12652600   -1.02761400
C                 -2.69746300    0.37859100   -0.12144800
C                 -1.95390000    1.00473300    0.80667700
C                 -1.86876100    2.34370300    0.82620700
S                 -2.77709400   -1.34523100   -0.17788400
O                 -1.95647000   -1.74920300   -1.27775200
O                 -2.74462100   -1.81932400    1.17216800
O                 -4.31876100   -1.66175700   -0.64008200
H                 -0.57113800    4.65340800   -1.24345400
H                 -0.90714900    6.18267100   -0.35912300
H                 -0.29259700    4.75298200    0.53296400
H                 -3.03525800    5.03588900   -0.88752600
H                 -2.96154900    6.30821600    1.24040200
H                 -4.03899800    4.87871000    1.40969000
H                 -2.39414300    4.86557400    2.14213100
H                 -3.81568700    3.04635000   -1.75918500
H                 -3.96133900    0.65607200   -1.81781200
H                 -1.39440300    0.43505400    1.56840400
H                 -1.24508100    2.82107400    1.59986300
H                 -4.62548800   -2.34663400   -0.07134800

1 2 1.0 5 2.0 15 1.0
2 3 1.0 16 1.0 17 1.0
3 4 1.0 18 1.0 19 1.0
4 8 2.0 9 1.0
5 6 1.0 7 1.0
6 20 1.0 21 1.0 22 1.0
7 23 1.0 24 1.0 25 1.0
8 10 2.0 26 1.0
9 27 1.0 28 1.0 29 1.0
10 11 2.0 30 1.0
11 12 2.0 31 1.0
12 13 1.0 14 2.0
13 32 1.0 33 1.0 34 1.0
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35 36 1.0 48 1.0 49 1.0 50 1.0
36 37 1.0 38 1.0 51 1.0
37 52 1.0 53 1.0 54 1.0
38 39 2.0 43 2.0
39 40 2.0 55 1.0
40 41 2.0 56 1.0
41 42 2.0 44 1.0
42 43 2.0 57 1.0
43 58 1.0
44 45 2.0 46 2.0 47 1.0
45
46
47 59 1.0
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59

products

0 1
C                 -6.84723000    0.35917100    0.35776400
C                 -5.77905300    1.22475500   -0.33613900
C                 -5.91363800    1.07974900   -1.86340200
C                 -4.39591200    0.76610900    0.09639500
C                 -4.05204100    0.80365100    1.39086500
C                 -2.72357900    0.36312300    1.80636400
C                 -1.84816100   -0.07871800    0.89316300
C                 -2.22282200   -0.11960600   -0.51732200
C                 -3.44213900    0.28468200   -0.89868600
S                 -0.21930600   -0.61875700    1.40255000
O                 -0.37171200   -1.82182300    2.66432800
O                  0.61983400   -1.31309000    0.03277900
O                  0.68622800    0.75060700    2.00848200
H                 -6.75194700    0.46187600    1.43877600
H                 -7.83899100    0.68808000    0.04759100
H                 -6.70667700   -0.68487800    0.07814000
H                 -5.91960600    2.26880300   -0.05651600
H                 -6.90543600    1.40856800   -2.17355400
H                 -5.15760800    1.69237200   -2.35456500
H                 -5.77312200    0.03561000   -2.14300500
H                 -4.75765500    1.15970500    2.12698500
H                 -2.44635100    0.39337200    2.84981900
H                 -1.51720900   -0.47566100   -1.25344200
H                 -3.71930000    0.25453300   -1.94206700
H                  1.55979900    0.46099400    2.28172500
C                  4.24374900   -1.33718500   -0.49037400
C                  2.71994400   -1.46672700   -0.30913900
C                  2.38311900   -1.48829300    1.19339600
C                  2.24508700   -2.77981600   -0.95295500
C                  0.70966000   -2.78627800   -0.94039000
C                  0.22204600   -1.71952000   -1.93425500
C                  0.88658500   -0.37892000   -1.65220500
C                  2.03619700   -0.27058900   -0.95741300
C                  0.22876000    0.88722600   -2.17623500
C                  2.64986400    1.04701200   -0.81936200
C                  3.79216800    1.18548900   -0.13277000
C                  4.40575900    2.50291000    0.00532200
C                  5.70152700    2.65996400    0.78420100
O                  3.87848500    3.47783300   -0.50435200
H                  4.58603600   -0.40760400   -0.03560300
H                  4.48409900   -1.33160700   -1.55349600
H                  4.73981400   -2.18082100   -0.01020600
H                  2.72720700   -0.56327600    1.65617400
H                  1.30477800   -1.57992000    1.32274100
H                  2.87892600   -2.33682500    1.66489600
H                  2.62331500   -3.62887500   -0.38354800
H                  2.60691300   -2.84047800   -1.97929100
H                  0.34739600   -2.55282400    0.06072800
H                  0.34169800   -3.76748800   -1.24033600
H                 -0.85838100   -1.61043900   -1.84004600
H                  0.46829400   -2.03495900   -2.94815800
H                 -0.77072500    0.97991600   -1.75152300
H                  0.82685400    1.75251900   -1.89012500
H                  0.15870100    0.83729100   -3.26281500
H                  2.18306300    1.90996500   -1.27065000
H                  4.25901800    0.32240300    0.31851600
H                  6.00421600    3.70702600    0.77867000
H                  5.54969900    2.33115500    1.81226200
H                  6.48006100    2.05423000    0.32031100

1 2 1.0 14 1.0 15 1.0 16 1.0
2 3 1.0 4 1.0 17 1.0
3 18 1.0 19 1.0 20 1.0
4 5 2.0 9 1.0
5 6 1.0 21 1.0
6 7 2.0 22 1.0
7 8 1.0 10 1.0
8 9 2.0 23 1.0
9 24 1.0
10 11 1.0 12 1.0 13 1.0
11
12
13 25 1.0
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26 27 1.0 40 1.0 41 1.0 42 1.0
27 28 1.0 29 1.0 33 1.0
28 43 1.0 44 1.0 45 1.0
29 30 1.0 46 1.0 47 1.0
30 31 1.0 48 1.0 49 1.0
31 32 1.0 50 1.0 51 1.0
32 33 2.0 34 1.0
33 35 1.0
34 52 1.0 53 1.0 54 1.0
35 36 2.0 55 1.0
36 37 1.0 56 1.0
37 38 1.0 39 2.0
38 57 1.0 58 1.0 59 1.0
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59

出错：try using 3 structures as input for qst transition state research
请多多帮忙，非常感谢！
赞一下 回复此楼
3楼2011-07-12 11:07:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

独孤狼

金虫 (正式写手)

独行者

【答案】应助回帖

rulongxu(金币+5): 很好。 2011-07-12 15:26:05
qst2并不意味着随便拉两个构象就能找过渡态，最起码你要想想这个体系该怎么反应吧。
赞一下 回复此楼
轮回的过往，注定的未来；独孤的行者，孤独的路途……
4楼2011-07-12 11:45:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rulongxu

至尊木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 独孤狼 at 2011-07-12 11:45:13:
qst2并不意味着随便拉两个构象就能找过渡态，最起码你要想想这个体系该怎么反应吧。

那应该怎么放啊？请指教，非常感谢！
赞一下 回复此楼
5楼2011-07-12 14:36:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

独孤狼

金虫 (正式写手)

独行者
★ ★ ★
gmy1990(金币+3): 2011-07-12 16:34:40
那是你的课题，你该自己想过该怎么做吧~~现在纸上划一下整个体系的电子推动作用，或者参照各种文献之类的把可能的机理找出来，然后你再考虑该怎么算机理，找过渡态……
赞一下(1人) 回复此楼
轮回的过往，注定的未来；独孤的行者，孤独的路途……
6楼2011-07-12 15:16:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

rulongxu

至尊木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 独孤狼 at 2011-07-12 15:16:29:
那是你的课题，你该自己想过该怎么做吧~~现在纸上划一下整个体系的电子推动作用，或者参照各种文献之类的把可能的机理找出来，然后你再考虑该怎么算机理，找过渡态……

好的。非常感谢。
回复此楼
7楼2011-07-12 15:25:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 rulongxu 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 293求调剂 +3 涛涛Wjt 2026-03-22 5/250 2026-03-22 22:21 by jiangpengfei
[考研] 305分求调剂（食品工程） +4 Sxy112 2026-03-21 6/300 2026-03-22 15:26 by 无懈可击111
[考研] 291 求调剂 +3 化工2026届毕业� 2026-03-21 3/150 2026-03-22 14:26 by ColorlessPI
[考研] 303求调剂 +5 安忆灵 2026-03-22 6/300 2026-03-22 12:46 by 素颜倾城1988
[考研] 一志愿深大，0703化学，总分302，求调剂 +4 七月-七七 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:20 by 学员8dgXkO
[考研] 求调剂 +3 .m.. 2026-03-21 4/200 2026-03-21 16:25 by barlinike
[考研] 083200学硕321分一志愿暨南大学求调剂 +3 innocenceF 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:35 by JourneyLucky
[考研] 初始318分求调剂（有工作经验） +3 1911236844 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:33 by JourneyLucky
[考研] 一志愿华南师大 070300（化学）304分求调剂 +3 0703武芊慧雪304 2026-03-18 3/150 2026-03-21 00:48 by JourneyLucky
[考研] 296求调剂 +6 www_q 2026-03-18 10/500 2026-03-20 23:56 by JourneyLucky
[考研] 304求调剂 +7 司空. 2026-03-18 7/350 2026-03-20 23:08 by JourneyLucky
[考研] 一志愿 西北大学 ，070300化学学硕，总分287，双非一本，求调剂。 +4 晨昏线与星海 2026-03-19 4/200 2026-03-20 22:15 by JourneyLucky
[考研] 求调剂，一志愿:南京航空航天大学大学 ，080500材料科学与工程学硕，总分289分 +4 @taotao 2026-03-19 4/200 2026-03-20 22:14 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工专硕调剂 +7 heming3743 2026-03-16 7/350 2026-03-20 19:31 by zhukairuo
[考研] 广西大学家禽遗传育种课题组2026年硕士招生（接收计算机专业调剂） +3 123阿标 2026-03-17 3/150 2026-03-20 15:58 by 飞行琦
[考研] 298-一志愿中国农业大学-求调剂 +9 手机用户 2026-03-17 9/450 2026-03-20 14:24 by 无懈可击111
[考研] 320求调剂0856 +3 不想起名字112 2026-03-19 3/150 2026-03-19 22:53 by 学员8dgXkO
[考研] 生物学调剂招人！！！ +3 山海天岚 2026-03-17 4/200 2026-03-19 21:34 by 怎么释怀
[考研] 283求调剂 +3 听风就是雨； 2026-03-16 3/150 2026-03-17 07:41 by 热情沙漠
[考研] 333求调剂 +3 文思客 2026-03-16 7/350 2026-03-16 18:21 by 文思客
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭