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rulongxu

至尊木虫 (小有名气)

[求助] 溶剂中过渡态查找

请问在溶剂中进行过渡态查找应该用什么方法？非常感谢！
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1楼 2011-07-12 08:46:04
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独孤狼

金虫 (正式写手)

独行者

【答案】应助回帖

★ ★
gmy1990(金币+2): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-07-12 10:54:42
和气相中一样，加上溶剂修正即可
赞一下(1人) 回复此楼
轮回的过往，注定的未来；独孤的行者，孤独的路途……
2楼2011-07-12 10:12:44
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rulongxu

至尊木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 独孤狼 at 2011-07-12 10:12:44:
和气相中一样，加上溶剂修正即可

我做的是非均相反应。催化剂为固体，氯仿为溶剂。运行之后出错。
# m052x/sto-3g scrf=(iefpcm,solvent=8,read) opt=(calcfc,qst2) geom=connectivity

reactants

0 1
C                 -0.20104900   -3.07667200    0.80309200
C                  0.90945800   -2.29920400    0.13823400
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C                 -2.20850800   -4.53359100    1.00112900
C                 -1.19574300   -4.10982400   -1.28432600
C                  3.56605300   -0.37174600    0.48273300
C                  1.74122100    0.78975300   -0.86413700
C                  4.63584700    0.24162800   -0.05370000
C                  5.89226100   -0.06181600    0.32051700
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C                 -1.95390000    1.00473300    0.80667700
C                 -1.86876100    2.34370300    0.82620700
S                 -2.77709400   -1.34523100   -0.17788400
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O                 -2.74462100   -1.81932400    1.17216800
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H                 -4.62548800   -2.34663400   -0.07134800

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14
15
16
17
18
19
20
21
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29
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32
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34
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5 6 1.0 21 1.0
6 7 2.0 22 1.0
7 8 1.0 10 1.0
8 9 2.0 23 1.0
9 24 1.0
10 11 1.0 12 1.0 13 1.0
11
12
13 25 1.0
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26 27 1.0 40 1.0 41 1.0 42 1.0
27 28 1.0 29 1.0 33 1.0
28 43 1.0 44 1.0 45 1.0
29 30 1.0 46 1.0 47 1.0
30 31 1.0 48 1.0 49 1.0
31 32 1.0 50 1.0 51 1.0
32 33 2.0 34 1.0
33 35 1.0
34 52 1.0 53 1.0 54 1.0
35 36 2.0 55 1.0
36 37 1.0 56 1.0
37 38 1.0 39 2.0
38 57 1.0 58 1.0 59 1.0
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59

出错：try using 3 structures as input for qst transition state research
请多多帮忙，非常感谢！
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3楼2011-07-12 11:07:43
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独行者

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rulongxu(金币+5): 很好。 2011-07-12 15:26:05
qst2并不意味着随便拉两个构象就能找过渡态，最起码你要想想这个体系该怎么反应吧。
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轮回的过往，注定的未来；独孤的行者，孤独的路途……
4楼2011-07-12 11:45:13
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rulongxu

至尊木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 独孤狼 at 2011-07-12 11:45:13:
qst2并不意味着随便拉两个构象就能找过渡态，最起码你要想想这个体系该怎么反应吧。

那应该怎么放啊？请指教，非常感谢！
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5楼2011-07-12 14:36:50
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独孤狼

金虫 (正式写手)

独行者
★ ★ ★
gmy1990(金币+3): 2011-07-12 16:34:40
那是你的课题，你该自己想过该怎么做吧~~现在纸上划一下整个体系的电子推动作用，或者参照各种文献之类的把可能的机理找出来，然后你再考虑该怎么算机理，找过渡态……
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轮回的过往，注定的未来；独孤的行者，孤独的路途……
6楼2011-07-12 15:16:29
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rulongxu

至尊木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 独孤狼 at 2011-07-12 15:16:29:
那是你的课题，你该自己想过该怎么做吧~~现在纸上划一下整个体系的电子推动作用，或者参照各种文献之类的把可能的机理找出来，然后你再考虑该怎么算机理，找过渡态……

好的。非常感谢。
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7楼2011-07-12 15:25:41
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