版块导航: 正在加载中...

登录注册

应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜

返回列表

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

rulongxu

至尊木虫 (小有名气)

应助: 2 (幼儿园)
金币: 10183.7
散金: 5
红花: 1
帖子: 160
在线: 241.9小时
虫号: 900106
注册: 2009-11-11
性别: GG
专业: 能源化工

[求助] 溶剂中过渡态查找

请问在溶剂中进行过渡态查找应该用什么方法？非常感谢！

回复此楼

» 猜你喜欢

华南师范大学广州市光谱分析与功能探针重点实验室诚招青年英才和博士后岗位研究人员已经有10人回复
夏威夷大学生物胶体与界面实验室诚招全奖博士生和博士后已经有1人回复
物理化学论文润色/翻译怎么收费? 已经有199人回复
200年来人们一直无法破解的难题：气液临界点状态方程已经有7人回复
关于引力延迟下双星系统角动量不守恒的疑惑---求高手解答！已经有10人回复
求助立方晶体In(OH)3的CIF卡片已经有2人回复
求标准卡片Cu0.4In0.4Zn1.2S2 PDF#32-0340 已经有2人回复
量子点电致发光器件（QLED）：蓝光量子点（QDs）和纳米氧化锌电子传输材料已经有0人回复
需要一个圆偏振光诱导化学反应，请问使用圆偏振光作为光源，应该需要哪些设备搭建已经有0人回复
[电子教材]天津大学物理化学（第七版）上、下册已经有0人回复

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

qst3寻找过渡态时出现不需要的虚频已经有8人回复
【求助】自由基耦合反应过渡态有过渡态吗？怎样计算其过渡态？已经有4人回复
过渡态已经有11人回复
过渡态搜索前原子配对问题已经有5人回复
请问能否在溶剂中只算过渡态单点能的情况下把虚频消掉？已经有12人回复
CH4在Ir（111）表面的解离吸附过渡态计算：Henkelman的PRL文章已经有10人回复
高斯计算过渡态时的能垒总是负值已经有13人回复
CASTEP过渡态搜索，过渡态能量低于反应物已经有12人回复
【求助】如何用QST2寻找反应过渡态已经有9人回复
【求助】高斯优化过渡态出错已经有14人回复
【求助】高斯计算过渡态不收敛，请问如何解决？已经有8人回复
【讨论】NEB寻找过渡态专题讨论已经有49人回复

1楼2011-07-12 08:46:04

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

独孤狼

金虫 (正式写手)

独行者

应助: 13 (小学生)
金币: 782.4
散金: 1313
红花: 9
帖子: 336
在线: 173.3小时
虫号: 816001
注册: 2009-07-26

★ ★ ★
gmy1990(金币+3): 2011-07-12 16:34:40

那是你的课题，你该自己想过该怎么做吧~~现在纸上划一下整个体系的电子推动作用，或者参照各种文献之类的把可能的机理找出来，然后你再考虑该怎么算机理，找过渡态……

赞一下(1人)

回复此楼

轮回的过往，注定的未来；独孤的行者，孤独的路途……

6楼2011-07-12 15:16:29

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

查看全部 7 个回答

独孤狼

金虫 (正式写手)

独行者

应助: 13 (小学生)
金币: 782.4
散金: 1313
红花: 9
帖子: 336
在线: 173.3小时
虫号: 816001
注册: 2009-07-26

【答案】应助回帖

★ ★
gmy1990(金币+2): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-07-12 10:54:42

和气相中一样，加上溶剂修正即可

赞一下(1人)

回复此楼

轮回的过往，注定的未来；独孤的行者，孤独的路途……

2楼2011-07-12 10:12:44

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

rulongxu

至尊木虫 (小有名气)

应助: 2 (幼儿园)
金币: 10183.7
散金: 5
红花: 1
帖子: 160
在线: 241.9小时
虫号: 900106
注册: 2009-11-11
性别: GG
专业: 能源化工

引用回帖:

Originally posted by 独孤狼 at 2011-07-12 10:12:44:
和气相中一样，加上溶剂修正即可

我做的是非均相反应。催化剂为固体，氯仿为溶剂。运行之后出错。
# m052x/sto-3g scrf=(iefpcm,solvent=8,read) opt=(calcfc,qst2) geom=connectivity

reactants

0 1
C                -0.20104900 -3.07667200 0.80309200
C                0.90945800 -2.29920400 0.13823400
C                1.19584200 -0.98224500 0.87909900
C                2.26971500 -0.17123100 0.17750300
C                -1.12400000 -3.84865500 0.20099900
C                -2.20850800 -4.53359100 1.00112900
C                -1.19574300 -4.10982400 -1.28432600
C                3.56605300 -0.37174600 0.48273300
C                1.74122100 0.78975300 -0.86413700
C                4.63584700 0.24162800 -0.05370000
C                5.89226100 -0.06181600 0.32051700
C                6.97834800 0.54682000 -0.22452200
C                8.33390900 0.08280400 0.28611400
O                6.91334500 1.40902300 -1.07195900
H                -0.23777800 -2.99194400 1.90160300
H                1.82685000 -2.93351000 0.14661300
H                0.66372800 -2.06792100 -0.92164800
H                0.26803400 -0.37200500 0.96430500
H                1.51185600 -1.20388400 1.92562400
H                -3.20941700 -4.19518200 0.64922300
H                -2.14538900 -5.63790900 0.87380400
H                -2.14894500 -4.31654300 2.09152600
H                -1.19686000 -5.20670600 -1.47467600
H                -2.13794500 -3.68713200 -1.70054500
H                -0.34736700 -3.68960800 -1.86547400
H                3.75960100 -1.13495800 1.25544900
H                2.51904900 1.33815100 -1.43643700
H                1.12053100 0.24499200 -1.61058600
H                1.09761200 1.55682500 -0.37673000
H                4.49080300 1.01140700 -0.82644500
H                6.06647200 -0.83310000 1.09067100
H                9.16092700 0.59573600 -0.25616300
H                8.44244300 0.31213700 1.37080000
H                8.45818300 -1.01332100 0.12967100
C                -0.97111200 5.07203700 -0.29064200
C                -2.42014000 4.61520000 -0.05449500
C                -2.98120300 5.19397700 1.25470200
C                -2.52287700 3.09844500 -0.07388400
C                -3.26672200 2.46558400 -0.99864400
C                -3.35017300 1.12652600 -1.02761400
C                -2.69746300 0.37859100 -0.12144800
C                -1.95390000 1.00473300 0.80667700
C                -1.86876100 2.34370300 0.82620700
S                -2.77709400 -1.34523100 -0.17788400
O                -1.95647000 -1.74920300 -1.27775200
O                -2.74462100 -1.81932400 1.17216800
O                -4.31876100 -1.66175700 -0.64008200
H                -0.57113800 4.65340800 -1.24345400
H                -0.90714900 6.18267100 -0.35912300
H                -0.29259700 4.75298200 0.53296400
H                -3.03525800 5.03588900 -0.88752600
H                -2.96154900 6.30821600 1.24040200
H                -4.03899800 4.87871000 1.40969000
H                -2.39414300 4.86557400 2.14213100
H                -3.81568700 3.04635000 -1.75918500
H                -3.96133900 0.65607200 -1.81781200
H                -1.39440300 0.43505400 1.56840400
H                -1.24508100 2.82107400 1.59986300
H                -4.62548800 -2.34663400 -0.07134800

1 2 1.0 5 2.0 15 1.0
2 3 1.0 16 1.0 17 1.0
3 4 1.0 18 1.0 19 1.0
4 8 2.0 9 1.0
5 6 1.0 7 1.0
6 20 1.0 21 1.0 22 1.0
7 23 1.0 24 1.0 25 1.0
8 10 2.0 26 1.0
9 27 1.0 28 1.0 29 1.0
10 11 2.0 30 1.0
11 12 2.0 31 1.0
12 13 1.0 14 2.0
13 32 1.0 33 1.0 34 1.0
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35 36 1.0 48 1.0 49 1.0 50 1.0
36 37 1.0 38 1.0 51 1.0
37 52 1.0 53 1.0 54 1.0
38 39 2.0 43 2.0
39 40 2.0 55 1.0
40 41 2.0 56 1.0
41 42 2.0 44 1.0
42 43 2.0 57 1.0
43 58 1.0
44 45 2.0 46 2.0 47 1.0
45
46
47 59 1.0
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59

products

0 1
C                -6.84723000 0.35917100 0.35776400
C                -5.77905300 1.22475500 -0.33613900
C                -5.91363800 1.07974900 -1.86340200
C                -4.39591200 0.76610900 0.09639500
C                -4.05204100 0.80365100 1.39086500
C                -2.72357900 0.36312300 1.80636400
C                -1.84816100 -0.07871800 0.89316300
C                -2.22282200 -0.11960600 -0.51732200
C                -3.44213900 0.28468200 -0.89868600
S                -0.21930600 -0.61875700 1.40255000
O                -0.37171200 -1.82182300 2.66432800
O                0.61983400 -1.31309000 0.03277900
O                0.68622800 0.75060700 2.00848200
H                -6.75194700 0.46187600 1.43877600
H                -7.83899100 0.68808000 0.04759100
H                -6.70667700 -0.68487800 0.07814000
H                -5.91960600 2.26880300 -0.05651600
H                -6.90543600 1.40856800 -2.17355400
H                -5.15760800 1.69237200 -2.35456500
H                -5.77312200 0.03561000 -2.14300500
H                -4.75765500 1.15970500 2.12698500
H                -2.44635100 0.39337200 2.84981900
H                -1.51720900 -0.47566100 -1.25344200
H                -3.71930000 0.25453300 -1.94206700
H                1.55979900 0.46099400 2.28172500
C                4.24374900 -1.33718500 -0.49037400
C                2.71994400 -1.46672700 -0.30913900
C                2.38311900 -1.48829300 1.19339600
C                2.24508700 -2.77981600 -0.95295500
C                0.70966000 -2.78627800 -0.94039000
C                0.22204600 -1.71952000 -1.93425500
C                0.88658500 -0.37892000 -1.65220500
C                2.03619700 -0.27058900 -0.95741300
C                0.22876000 0.88722600 -2.17623500
C                2.64986400 1.04701200 -0.81936200
C                3.79216800 1.18548900 -0.13277000
C                4.40575900 2.50291000 0.00532200
C                5.70152700 2.65996400 0.78420100
O                3.87848500 3.47783300 -0.50435200
H                4.58603600 -0.40760400 -0.03560300
H                4.48409900 -1.33160700 -1.55349600
H                4.73981400 -2.18082100 -0.01020600
H                2.72720700 -0.56327600 1.65617400
H                1.30477800 -1.57992000 1.32274100
H                2.87892600 -2.33682500 1.66489600
H                2.62331500 -3.62887500 -0.38354800
H                2.60691300 -2.84047800 -1.97929100
H                0.34739600 -2.55282400 0.06072800
H                0.34169800 -3.76748800 -1.24033600
H                -0.85838100 -1.61043900 -1.84004600
H                0.46829400 -2.03495900 -2.94815800
H                -0.77072500 0.97991600 -1.75152300
H                0.82685400 1.75251900 -1.89012500
H                0.15870100 0.83729100 -3.26281500
H                2.18306300 1.90996500 -1.27065000
H                4.25901800 0.32240300 0.31851600
H                6.00421600 3.70702600 0.77867000
H                5.54969900 2.33115500 1.81226200
H                6.48006100 2.05423000 0.32031100

1 2 1.0 14 1.0 15 1.0 16 1.0
2 3 1.0 4 1.0 17 1.0
3 18 1.0 19 1.0 20 1.0
4 5 2.0 9 1.0
5 6 1.0 21 1.0
6 7 2.0 22 1.0
7 8 1.0 10 1.0
8 9 2.0 23 1.0
9 24 1.0
10 11 1.0 12 1.0 13 1.0
11
12
13 25 1.0
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26 27 1.0 40 1.0 41 1.0 42 1.0
27 28 1.0 29 1.0 33 1.0
28 43 1.0 44 1.0 45 1.0
29 30 1.0 46 1.0 47 1.0
30 31 1.0 48 1.0 49 1.0
31 32 1.0 50 1.0 51 1.0
32 33 2.0 34 1.0
33 35 1.0
34 52 1.0 53 1.0 54 1.0
35 36 2.0 55 1.0
36 37 1.0 56 1.0
37 38 1.0 39 2.0
38 57 1.0 58 1.0 59 1.0
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59

出错：try using 3 structures as input for qst transition state research
请多多帮忙，非常感谢！

赞一下

回复此楼

3楼2011-07-12 11:07:43

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

独孤狼

金虫 (正式写手)

独行者

应助: 13 (小学生)
金币: 782.4
散金: 1313
红花: 9
帖子: 336
在线: 173.3小时
虫号: 816001
注册: 2009-07-26

【答案】应助回帖

rulongxu(金币+5): 很好。 2011-07-12 15:26:05

qst2并不意味着随便拉两个构象就能找过渡态，最起码你要想想这个体系该怎么反应吧。

赞一下

回复此楼

轮回的过往，注定的未来；独孤的行者，孤独的路途……

4楼2011-07-12 11:45:13

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

查看全部 7 个回答