应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 怎么查到表 达特定蛋白的细胞?
51/1返回列表
查看: 680  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
本帖产生 2 个 MolEPI ，点击这里进行查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

256k

新虫 (正式写手)

[交流] 怎么查到表 达特定蛋白的细胞?

文献中找，是个方法，但是效率太低了？有更好的方法么？
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

【分子生物】EPI帖

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

256k

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-07-08 13:16:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

256k

新虫 (正式写手)
这个第二种方法，即通过blast还是详细赐教下好不好
赞一下 回复此楼
3楼2011-07-08 16:53:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

gwbk

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
256k(金币+1):谢谢参与
256k(金币+3): 2011-07-08 16:52:54
西瓜(金币+5, EPI+1): Good！ 2011-07-08 19:07:19
其实呢，找到参考文献是比较简单的方法，下面是比较复杂一点的，有可能找出上万条相似序列，很难筛选的。
1，去NCBI上找就可以，比如你要找的蛋白名称是aspartate semialdehyde dehydrogenase，在搜索栏输入“aspartate semialdehyde dehydrogenase”，search选择“protein”。搜索出来的蛋白名称后面有个[ ]，比如aspartate semialdehyde dehydrogenase [Bacteroides helcogenes P 36-108]，括号里面就是你想要的菌名称。
2，如果你知道序列，也可以通过blast的方法寻找菌株。这个就不用详细介绍了吧。这个方法最准确。
3，去EBI寻找aspartate semialdehyde dehydrogenase，搜索之后，在左侧栏有个分类，什么基因，蛋白啊，很详细。进入in srs以后可以看到Organism source和Taxonomy 等信息。
还有很多数据库可以用。我基本都在这两个库查。
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2011-07-08 16:06:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gwbk

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
dhd997(金币+5, EPI+1): 牛啊，视频也可以做。 2011-07-09 08:08:43
我这网速好慢啊~~

这个说起来比较麻烦，干脆做个视频吧~
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-07-08 20:27:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

256k

新虫 (正式写手)
送鲜花一朵
thank you very much
赞一下 回复此楼
5楼2011-07-09 09:28:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭