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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » DS 3.0分子优化
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yylazy

银虫 (小有名气)

[求助] DS 3.0分子优化

亲亲们好：
          在DS 3.0中对小分子优化时怎样对分子加电荷，在Minimzation选项中有吗？怎样评价一个分子的优化结果？？
          金币少，只能送10个了！！！！
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1楼2011-07-04 20:35:45
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yylazy

银虫 (小有名气)
补充问题：分子对接需找活性位点时必须要根据文献报道的来？？？
              自己寻找或者软件找到的位点是不是没说服力？？？、
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2楼2011-07-06 18:50:14
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qixingbao07

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
yylazy(金币+5): 十分感谢 2011-07-07 12:17:10
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-07-07 15:51:47
引用回帖:
Originally posted by yylazy at 2011-07-06 18:50:14:
补充问题：分子对接需找活性位点时必须要根据文献报道的来？？？
              自己寻找或者软件找到的位点是不是没说服力？？？、

肯定要根据文献，否则不行的
tools中的simulation structure有加力场，我一般CHARMm，MMFF94。有时Momany-Rone代替MMFF94。
仅是个人意见，不对之处欢迎指正
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3楼2011-07-07 08:35:33
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menz

金虫 (小有名气)
求DS 3.0下载地址，多谢lz！menz45[at]gmail.com
谢啦~
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4楼2011-07-08 14:55:47
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yylazy

银虫 (小有名气)
我们这边是买的，不清楚哦，弱弱的问：下载的能用？？？
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5楼2011-07-09 10:08:35
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menz

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by yylazy at 2011-07-09 10:08:35:
我们这边是买的，不清楚哦，弱弱的问：下载的能用？？？

从verycd上下了个DS2.5，只试了其中几个模块，目前没发现不能用的。呵呵。想找个DS3.0试试。
请问你们是怎么买的，多少钱啊？
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6楼2011-07-09 21:23:27
 已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yylazy

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by menz at 2011-07-09 21:23:27:
从verycd上下了个DS2.5，只试了其中几个模块，目前没发现不能用的。呵呵。想找个DS3.0试试。
请问你们是怎么买的，多少钱啊？

创腾公司，几个模块，15W左右
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7楼2011-07-10 12:06:03
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chemozhang

木虫 (正式写手)
帖子真精彩!
已经收录到淘贴专辑《Discovery Studio 常见问题及使用教程》
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故地如重游月圆更寂寞
8楼2011-09-05 19:08:34
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