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vetzcm

木虫 (正式写手)

[交流] 请问在做药物分子对接时药物分子结构文件的准备 已有5人参与

大家好!我想请教下,如果做药物分子与蛋白质分子对接,目标药物分子自己绘制结构时,是绘制成完整分子形式还是药物的离子形式呢?两者有影响吗?麻烦了解的各位虫友帮帮忙,十分感谢!
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-07-01 19:44:22
引用回帖:
Originally posted by vetzcm at 2011-06-30 16:00:32:
谢谢你!也就是说,我可以根据我目标药物的CAS号网上下载药物的Mol文件,然后转换成我需要的文件格式mol2(比如加上gasteiger charges等),就可以进行对接了是吗?

加氢,加电荷,赋力场,简单做500优化。
除了你的亲人,没有人应该对你好,对你好的人,一定要珍惜。
4楼2011-07-01 07:03:04
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