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xiezhenrong

金虫 (正式写手)

北斗星

[求助] 如何进行分子鉴定一株未知藻?

先前对藻形态学鉴定其与纤细纤维藻很相似,后面根据文献报道以及NCBI上设计一些18srDNA引物PCR不是扩增不出条带就是测序比对覆盖度不够,而这些引物对其它藻的PCR扩增和测序结果都理想,想请教大家,针对这种情况下面该如何进行?谢谢!
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caihy119

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

xiezhenrong(金币+2): 用过18sPCR通用引物,P不出来,后面就查了一些外文文献做藻的很多人都用过的引物还是一样P不出来,换了几次PCR条件也是一样,所做的pcr获得条带有些是800bp左右,有些是1000到2000bp左右,很多文献报道条带大小一致,但是比对出来相似性只有97% 2011-06-23 15:28:05
xiezhenrong(金币+1): 2011-06-28 20:01:01
尝试一下18s PCR 通用引物, 最好测序得结果是全长的, 你可能选择的引物扩增的长度不够.
2楼2011-06-22 16:52:32
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redlizi

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

xiezhenrong(金币+2): 没有做过,回头研究研究,谢谢你的提醒 2011-06-25 09:19:47
xiezhenrong(金币+1): 2011-06-28 20:02:34
用ITS 序列吧,进化速度快,差异大
3楼2011-06-24 15:39:12
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