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rock0927

铁虫 (正式写手)

[求助] 分子结构优化

将两个反应物画在gaussian view里,然后进行结构优化可以吗?我计算的时候总是出现错误,求指导。
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rock0927

铁虫 (正式写手)

高人再给我指点一下啊
4楼2011-06-13 08:58:43
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查看全部 9 个回答

zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

rock0927(金币+2): 谢谢 2011-06-12 19:10:46
将两个反应物画在gaussian view里,然后进行结构优化是可以的。它是反应的初始起点。

计算的时候总是出现错误,因没有贴出相关文件,可能性太多,很难说是什么原因。

首先两个反应物位置放得不对。
其次两个反应物放在一起,它们有各种作用,如果仅是范德华力,要考虑包含电子相关的计算方法,如G09中的b97d之类。
2楼2011-06-12 15:49:32
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rock0927

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by zhou2009 at 2011-06-12 15:49:32:
将两个反应物画在gaussian view里,然后进行结构优化是可以的。它是反应的初始起点。

计算的时候总是出现错误,因没有贴出相关文件,可能性太多,很难说是什么原因。

首先两个反应物位置放得不对。
其次两 ...

非常感谢你的回答,我的反应是丙烷碳正离子与丙烯的反应,碳正离子攻击双键碳原子,要算反应的过渡态,现在是想将反应物进行结构优化,最后出现的错误是 link died, 没有优化成功。

3楼2011-06-12 19:10:10
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独孤狼

金虫 (正式写手)

独行者

【答案】应助回帖

rock0927(金币+1): 谢谢 2011-06-13 11:10:43
构型貌似没搭错,把输出文件最后的具体错误信息贴出来呀。link died太抽象了。
轮回的过往,注定的未来;独孤的行者,孤独的路途……
5楼2011-06-13 10:24:22
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