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sumwindy

金虫 (正式写手)

[求助] 游离水分子氧的精修

结构中有许多游离的水分子氧,未精修时,温度因子都很大,最大的有0.3
通过改变他们的占有率,修到如下程度:
O1   10.5(占有率)    0.1(Ueq)  
O2   10.5                 0.09
O3   10.5                 0.11
O4   11.0                 0.33
O5   10.5                 0.18
O6   10.25               0.07
O7   10.25                0.23
O8   10.25                 0.14
剩下的q峰中,最重是1.07和0.98,距离是1.18埃,需要定成O嘛?
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454106649

木虫 (著名写手)


drg1984(金币+1): 感谢回帖交流! 2011-05-31 11:50:45
占有率不是随便改的!游离水实在定不下来就不定了!
454106649@qq.com
2楼2011-05-31 10:30:26
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sumwindy

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 454106649 at 2011-05-31 10:30:26:
占有率不是随便改的!游离水实在定不下来就不定了!

遇到这种情况,你是如何处理的呢?
3楼2011-05-31 10:39:32
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hanfeifei122

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


drg1984(金币+1): 感谢应助回帖! 2011-05-31 11:50:32
引用回帖:
Originally posted by sumwindy at 2011-05-31 10:09:09:
结构中有许多游离的水分子氧,未精修时,温度因子都很大,最大的有0.3
通过改变他们的占有率,修到如下程度:
O1   10.5(占有率)    0.1(Ueq)  
O2   10.5                 0.09
O3   10.5                 ...

试一下把各个Q进行part 操作如
part 1
o1
part 2
o2
prat 3
o3
part 4
o4
……
part 0
哈哈哈……
4楼2011-05-31 11:47:18
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sumwindy

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by hanfeifei122 at 2011-05-31 11:47:18:
试一下把各个Q进行part 操作如
part 1
o1
part 2
o2
prat 3
o3
part 4
o4
……
part 0

ls上的命令, 我在将一个原子劈裂成2个的时候见过,也就是part1 part2 part0.如何劈成更多,相应的原子坐标从哪儿找啊?lst文件中并没有提示有需要split的原子。
5楼2011-05-31 13:28:13
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454106649

木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by sumwindy at 2011-05-31 10:39:32:
遇到这种情况,你是如何处理的呢?

具体分析吧!我现在处理的也不熟练!
454106649@qq.com
6楼2011-05-31 13:45:01
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hanfeifei122

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
Originally posted by hanfeifei122 at 2011-05-31 11:47:18:
试一下把各个Q进行part 操作如
part 1
o1
part 2
o2
prat 3
o3
part 4
o4
……
part 0

我试过三个的,多的就不知道了……
哈哈哈……
7楼2011-06-03 17:50:16
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sumwindy

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by hanfeifei122 at 2011-06-03 17:50:16:
我试过三个的,多的就不知道了……

没有原子坐标,怎么劈啊?
8楼2011-06-04 08:21:39
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