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km-lhf

金虫 (正式写手)

[交流] 【请教】图中只有一个O而CIf中有两个,怎么办? 已有8人参与

得到一个晶体,用Mercury 查看,只有一个游离水的O,但是cif 文件中的O数目,却是两个,请教高手,这是怎么回事?
先声明,没有人教我解析晶体,没有系统地学过,一切都是自学,所以,估计是自己的问题,但是,对我来说是天大的问题。SOS。
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好好学习,天天向上。
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km-lhf

金虫 (正式写手)

顶上去,请高手~
好好学习,天天向上。
2楼2011-02-13 11:13:44
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lililei

捐助贵宾 (正式写手)

漓离雨——漓水之歌


★ ★
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nash603(金币+1): 谢谢回贴交流! 2011-02-13 17:10:09
你是不是说你的cif中分子式计算出来是两个水分子O,与Hg读出的不同?

你可以直接在SHEXL的XP中看你的游离水分子是几个啊!

还有就是你应该检查你晶体解析过程中,对晶体分子式确定的时候有没有弄错
3楼2011-02-13 12:58:54
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wujinji

金虫 (正式写手)

★ ★
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nash603(金币+1): 谢谢回贴交流! 2011-02-13 17:10:16
那个氧是不是你配体上的?或者是配位水?
4楼2011-02-13 13:40:34
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km-lhf

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by lililei at 2011-02-13 12:58:54:
你是不是说你的cif中分子式计算出来是两个水分子O,与Hg读出的不同?

你可以直接在SHEXL的XP中看你的游离水分子是几个啊!

还有就是你应该检查你晶体解析过程中,对晶体分子式确定的时候有没有弄错

我在Xp中看到是一个氧(水的),而在Cif中看到的分子式应该有两个。请教。谢谢。
好好学习,天天向上。
5楼2011-02-14 13:17:38
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km-lhf

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by wujinji at 2011-02-13 13:40:34:
那个氧是不是你配体上的?或者是配位水?

高手,我问的是游离水,在Xp 和Hg中只看到一个,而在CIf中看到两个,怎么解决?先谢谢。
好好学习,天天向上。
6楼2011-02-14 13:18:34
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wujinji

金虫 (正式写手)

★ ★
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nash603(金币+1): 给个红包,谢谢回帖交流 2011-02-14 19:58:51
你是在cif文件中的哪里看到你的化合物有2个水分子的?分子式的话问题不大,就是软件确定分子式的时候乘2了。
7楼2011-02-14 13:47:09
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

★ ★
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nash603(金币+1): 给个红包,谢谢回帖交流 2011-02-14 19:58:59
试着看一下XP下能看到的O的编号,然后看一下CIF中多出的氧的编号(或是从INS文件中查找),把多出来的O删除了,再精修,也许能找到问题所在。
8楼2011-02-14 13:49:47
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zqfkkd

铁杆木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
nash603(金币+1): 给个红包,谢谢回帖交流 2011-02-14 19:59:10
呵呵。都没回答到点子上。
这个是对称性造成的,估计这个东西是中心对称的,或是有C2轴。
这个游离水离主体分子比较远。用MERCURY或XP看的时候,没长出对称的那个水分子来。
单从晶体学来看,CIF文件是正确的。
9楼2011-02-14 13:55:48
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km-lhf

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by zqfkkd at 2011-02-14 13:55:48:
呵呵。都没回答到点子上。
这个是对称性造成的,估计这个东西是中心对称的,或是有C2轴。
这个游离水离主体分子比较远。用MERCURY或XP看的时候,没长出对称的那个水分子来。
单从晶体学来看,CIF文件是正确的。

谢谢您!再请教一下,我在XP中grow了,还是没有长出对称的水来,不知道这对投稿有没有影响呢?谢谢。
好好学习,天天向上。
10楼2011-02-14 14:45:17
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