24小时热门版块排行榜    

查看: 3183  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

阿黛拉

银虫 (小有名气)


[交流] 有关vasp中dimer方法的交流

dimer :method for finding reaction pathways when only one state is known。

虽然计算时仅需一种状态被确定,但是MODECAR(设计需要2个POSCAR)最好给出。
如果不被给出,则计算按自由的方向进行。

有关dimer的脚本还有
diminit.pl       

usage: diminit.pl (DIR or number)
                  (DisplaceAlgo) (DisplaceRange) (Rcut)
                  (MaxCord) (POSCAR) (DISPLACECAR_sp)
output: DIR or prXXXX containing files for dimer runs

Generates an initialized dimer run in DIR or the numbered directories prXXXX, from a POSCAR and DISPLACECAR


dimmins.pl       

usage: dimmins.pl (POSCAR1) (POSCAR2) (displacement)
output: mins/min1/POSCAR mins/min2/POSCAR (and related files)


Generates initial configurations which can be minimized from a converged dimer run.

对于这两个脚本希望大家多多交流。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

youzhizhe(金币+1): 谢谢交流。 2011-08-19 16:42:05
dimer方法的物理意义我不明白:

NEB是找能量面上的一条MEP。dimer是两个点,这两个点书虚拟的,没有质量,只有坐标?是能量面上的一对点?

dimer收敛到过渡态的时候,七方向跟虚频的方向一致。请问虚频的方向是什么意思?
3楼2011-08-18 21:03:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

阿黛拉(金币+1):谢谢参与
这个帖子没有人回复?
2楼2011-08-18 20:59:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wanghui381

金虫 (小有名气)



阿黛拉(金币+1):谢谢参与
关注。。正在尝试dimer方法,做出的结果总不理想,不知参数设置细节有没有什么说法,效率是不是比CINEB高?
4楼2011-11-23 14:46:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jianghuaih

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
各位能留个联系方式吗?我也刚做这个,想请教些问题。
6楼2019-05-06 15:01:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 好奇怪的filecode +3 布布和一二 2026-08-08 4/200 2026-08-08 17:46 by zhanghaozhu
[找工作] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 4/200 2026-08-08 17:07 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 5/250 2026-08-08 17:02 by oEVWOejN9taj
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 5/250 2026-08-08 16:47 by oEVWOejN9taj
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 4/200 2026-08-08 16:27 by oEVWOejN9taj
[考博] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 4/200 2026-08-08 16:22 by oEVWOejN9taj
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 5/250 2026-08-08 15:59 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +5 布布和一二 2026-08-08 8/400 2026-08-08 14:54 by archvillain
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 6/300 2026-08-08 14:47 by oEVWOejN9taj
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 6/300 2026-08-08 14:42 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 4/200 2026-08-08 14:27 by oEVWOejN9taj
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 Vi50GxzrFcSG 2026-08-07 6/300 2026-08-08 10:19 by 3OOjAIS77qg2
[基金申请] 基金中了 +14 laoda193707 2026-08-06 14/700 2026-08-08 00:23 by 实验小白ha
[基金申请] 娱乐 +6 Tide man 2026-08-03 6/300 2026-08-07 22:40 by 铁帽子农民
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 好消息?这个有何含义??? +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
[考博] 【2027博士申请】纳米药物递送方向 20+3 13586093586 2026-08-03 4/200 2026-08-05 09:59 by lfy8008
[基金申请] 有没有H口的?有收到消息的吗? +3 超级海虾 2026-08-04 3/150 2026-08-04 17:26 by 学教育滴
[基金申请] 面上提前没消息,有中的吗 +14 archvillain 2026-08-02 18/900 2026-08-04 14:42 by archvillain
信息提示
请填处理意见